RNA polymerase pausing during initial transcription

RNA polymerase pausing during initial transcription

In bacteria, RNA polymerase (RNAP) initiates transcription by synthesizing short transcripts that are either released or extended to allow RNAP to escape from the promoter. The mechanism of initial transcription is unclear due to the presence of transient intermediates and molecular heterogeneity. H...

תיאור מלא

מידע ביבליוגרפי
Main Authors:	Duchi, D, Bauer, D, Fernandez, L, Evans, G, Robb, N, Hwang, L, Gryte, K, Tomescu, A, Zawadzki, P, Morichaud, Z, Brodolin, K, Kapanidis, A
פורמט:	Journal article
שפה:	English
יצא לאור:	Cell Press 2016

פריטים דומים

Conformational heterogeneity and bubble dynamics in single bacterial transcription initiation complexes
מאת: Duchi, D, et al.
יצא לאור: (2017)

Pausing controls branching between productive and non-productive pathways during initial transcription in bacteria
מאת: Dulin, D, et al.
יצא לאור: (2018)

The transcription bubble of the RNA polymerase-promoter open complex exhibits conformational heterogeneity and millisecond-scale dynamics: Implications for transcription start-site selection
מאת: Robb, N, et al.
יצא לאור: (2013)

The transcription bubble of the RNA polymerase-promoter open complex exhibits conformational heterogeneity and millisecond-scale dynamics: implications for transcription start-site selection.
מאת: Robb, N, et al.
יצא לאור: (2013)

Pausing controls branching between productive and non-productive pathways during initial transcription in bacteria
מאת: David Dulin, et al.
יצא לאור: (2018-04-01)

Single-Molecule Studies of Transcription Initiation using a Vesicle Approach
מאת: Llumigusin, D, et al.
יצא לאור: (2012)

CDK9-dependent RNA polymerase II pausing controls transcription initiation
מאת: Saskia Gressel, et al.
יצא לאור: (2017-10-01)

Real-time transcription initiation by E. coli RNA polymerase in vitro and in vivo
מאת: Plochowietz, A, et al.
יצא לאור: (2015)

RNA polymerase II pausing in development: orchestrating transcription
מאת: Abderhman Abuhashem, et al.
יצא לאור: (2022-01-01)

Sensing DNA opening in transcription using quenchable Forster resonance energy transfer.
מאת: Cordes, T, et al.
יצא לאור: (2010)

A pause site for RNA polymerase II is associated with termination of transcription.
מאת: Enriquez-Harris, P, et al.
יצא לאור: (1991)

Role of R-loops in pause-dependent transcriptional termination of RNA polymerase II
מאת: Skourti-Stathaki, K
יצא לאור: (2012)

Pause sequences facilitate entry into long-lived paused states by reducing RNA polymerase transcription rates
מאת: Ronen Gabizon, et al.
יצא לאור: (2018-07-01)

Pause sites promote transcriptional termination of mammalian RNA polymerase II.
מאת: Gromak, N, et al.
יצא לאור: (2006)

Role of RNA Polymerase II Promoter-Proximal Pausing in Viral Transcription
מאת: Marilyn Whelan, et al.
יצא לאור: (2022-09-01)

Characterizing Influenza a RNA Polymerase - Promoter Interaction using Ensemble Fluorescence Spectroscopy
מאת: Tomescu, A, et al.
יצא לאור: (2013)

Single-molecule FRET reveals a corkscrew RNA structure for the polymerase-bound influenza virus promoter.
מאת: Tomescu, A, et al.
יצא לאור: (2014)

Initial transcription by RNA polymerase proceeds through a DNA-scrunching mechanism.
מאת: Kapanidis, A, et al.
יצא לאור: (2006)

Structural basis of the mycobacterial stress-response RNA polymerase auto-inhibition via oligomerization
מאת: Zakia Morichaud, et al.
יצא לאור: (2023-01-01)

Single-molecule studies of transcription initiation
מאת: Duchi Llumigusin, D, et al.
יצא לאור: (2014)

The RNA polymerase clamp interconverts dynamically among three states and is stabilized in a partly closed state by ppGpp
מאת: Duchi, D, et al.
יצא לאור: (2018)

A Role for FACT in RNA Polymerase II Promoter-Proximal Pausing
מאת: Theophilus T. Tettey, et al.
יצא לאור: (2019-06-01)

A-MYB and BRDT-dependent RNA Polymerase II pause release orchestrates transcriptional regulation in mammalian meiosis
מאת: Adriana K. Alexander, et al.
יצא לאור: (2023-03-01)

The pause-initiation limit restricts transcription activation in human cells
מאת: Saskia Gressel, et al.
יצא לאור: (2019-08-01)

Reporter-ChIP-nexus reveals strong contribution of the Drosophila initiator sequence to RNA polymerase pausing
מאת: Wanqing Shao, et al.
יצא לאור: (2019-04-01)

The elemental mechanism of transcriptional pausing
מאת: Jason Saba, et al.
יצא לאור: (2019-01-01)

Poly(A) signals and transcriptional pause sites combine to prevent interference between RNA polymerase II promoters.
מאת: Eggermont, J, et al.
יצא לאור: (1993)

RNA polymerase II pausing downstream of core histone genes is different from genes producing polyadenylated transcripts.
מאת: Krishanpal Anamika, et al.
יצא לאור: (2012-01-01)

Improved temporal resolution and linked hidden Markov modeling for switchable single-molecule FRET.
מאת: Uphoff, S, et al.
יצא לאור: (2011)

Transcription Pause and Escape in Neurodevelopmental Disorders
מאת: Kristel N. Eigenhuis, et al.
יצא לאור: (2022-05-01)

Tyrosine 1-phosphorylated RNA polymerase II transcribes PROMPTs to facilitate proximal promoter pausing and induce global transcriptional repression in response to DNA damage
מאת: Ajit, K, et al.
יצא לאור: (2024)

New core promoter element in RNA polymerase II-dependent transcription: sequence-specific DNA binding by transcription factor IIB.
מאת: Lagrange, T, et al.
יצא לאור: (1998)

Transcriptional regulation: effects of promoter proximal pausing on speed, synchrony and reliability.
מאת: Alistair N Boettiger, et al.
יצא לאור: (2011-05-01)

RNA Polymerase II pausing temporally coordinates cell cycle progression and erythroid differentiation
מאת: Martell, DJ, et al.
יצא לאור: (2023)

RNA polymerase II pausing temporally coordinates cell cycle progression and erythroid differentiation.
מאת: Martell, DJ, et al.
יצא לאור: (2023)

Grounded: Transcriptional Pausing in Naive mESCs
מאת: Guenther, Matthew G., et al.
יצא לאור: (2014)

YEAST RNA POLYMERASE-II TRANSCRIPTION - ENZYMATIC-ACTIVITIES OF GENERAL INITIATION-FACTORS, 3-D STRUCTURES OF INITIATION-FACTORS AND RNA-POLYMERASE, AND MECHANISM OF TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION
מאת: Kornberg, R, et al.
יצא לאור: (1992)

Structures of co-transcriptional RNA capping enzymes on paused transcription complex
מאת: Yan Li, et al.
יצא לאור: (2024-05-01)

Definition of transcriptional pause elements in fission yeast.
מאת: Aranda, A, et al.
יצא לאור: (1999)

c-Myc regulates transcriptional pause release
מאת: Rahl, Peter B., et al.
יצא לאור: (2012)