Practical approaches for detecting selection in microbial genomes

Practical approaches for detecting selection in microbial genomes

Microbial genome evolution is shaped by a variety of selective pressures. Understanding how these processes occur can help to address important problems in microbiology by explaining observed differences in phenotypes, including virulence and resistance to antibiotics. Greater access to whole-genome...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Hedge, J, Wilson, D
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	Public Library of Science 2016

Những quyển sách tương tự

Practical Approaches for Detecting Selection in Microbial Genomes.
Bằng: Jessica Hedge, et al.
Được phát hành: (2016-02-01)

Bacterial phylogenetic reconstruction from whole genomes is robust to recombination but demographic inference is not
Bằng: Hedge, J, et al.
Được phát hành: (2014)

Bacterial Phylogenetic Reconstruction from Whole Genomes Is Robust to Recombination but Demographic Inference Is Not
Bằng: Jessica Hedge, et al.
Được phát hành: (2014-12-01)

Big data approaches to microbial genomics
Bằng: Arning, N
Được phát hành: (2022)

Abiotic selection of microbial genome size in the global ocean
Bằng: David K. Ngugi, et al.
Được phát hành: (2023-03-01)

Genomic signatures of sex, selection and speciation in the microbial world
Bằng: Shapiro, B. Jesse (Benjamin Jesse)
Được phát hành: (2011)

Phylogenetic detection of conserved gene clusters in microbial genomes
Bằng: Anton Brian P, et al.
Được phát hành: (2005-10-01)

Interpreting Microbial Biosynthesis in the Genomic Age: Biological and Practical Considerations
Bằng: Ian J. Miller, et al.
Được phát hành: (2017-06-01)

Detecting positive selection in the genome
Bằng: Tom R. Booker, et al.
Được phát hành: (2017-10-01)

Approaches for in silico finishing of microbial genome sequences
Bằng: Frederico Schmitt Kremer, et al.

Novel phylogenetic approaches to problems in microbial genomics
Bằng: David, Lawrence A. (Lawrence Anthony)
Được phát hành: (2011)

A new approach for using genome scans to detect recent positive selection in the human genome.
Bằng: Kun Tang, et al.
Được phát hành: (2007-07-01)

On detecting selective sweeps using single genomes
Bằng: Priyanka eSinha, et al.
Được phát hành: (2011-12-01)

Microbial genome sequencing and pathogenesis.
Bằng: Tang, C, et al.
Được phát hành: (1998)

GenomeViz: visualizing microbial genomes
Bằng: Chakraborty Trinad, et al.
Được phát hành: (2004-12-01)

A hybrid clustering approach to recognition of protein families in 114 microbial genomes
Bằng: Gogarten J Peter, et al.
Được phát hành: (2004-04-01)

Microbial functional genomics /
Bằng: Zhou, Jizhong, 1959-
Được phát hành: (2004)

Microbial genomics and drug discovery /
Bằng: Dougherty, Thomas J. (Thomas John), 1950-, et al.
Được phát hành: (2003)

Pilon: an integrated tool for comprehensive microbial variant detection and genome assembly improvement.
Bằng: Bruce J Walker, et al.
Được phát hành: (2014-01-01)

Best Practices for Evaluating Single Nucleotide Variant Calling Methods for Microbial Genomics
Bằng: Nathan eOlson, et al.
Được phát hành: (2015-07-01)

Editorial: Microbial comparative genomics and pangenomics: new tools, approaches and insights into gene and genome evolution
Bằng: Digvijay Verma, et al.
Được phát hành: (2024-10-01)

A New Genome-to-Genome Comparison Approach for Large-Scale Revisiting of Current Microbial Taxonomy
Bằng: Ming-Hsin Tsai, et al.
Được phát hành: (2019-06-01)

Pharmaceutical products microbial contamination; approaches of detection and avoidance
Bằng: Zahraa Hashim, et al.
Được phát hành: (2025-02-01)

Assessment the effect of genomic selection and detection of selective signature in broilers
Bằng: Xiaodong Tan, et al.
Được phát hành: (2022-06-01)

Screening for oral cancers: Future perspectives
Bằng: Nidarsh D. Hedge, et al.
Được phát hành: (2018-01-01)

Strain-level profiling of viable microbial community by selective single-cell genome sequencing
Bằng: Masahito Hosokawa, et al.
Được phát hành: (2022-03-01)

Dynamic probe selection for studying microbial transcriptome with high-density genomic tiling microarrays
Bằng: Chen Tsute, et al.
Được phát hành: (2010-02-01)

Genome-wide detection and characterization of positive selection in human populations.
Bằng: Sabeti, P, et al.
Được phát hành: (2007)

Comparative Genomics and Understanding of Microbial Biology
Bằng: Claire M. Fraser, et al.
Được phát hành: (2000-10-01)

Detecting recent positive selection in the human genome from haplotype structure.
Bằng: Sabeti, P, et al.
Được phát hành: (2002)

Genomic selection - Revolutionary breeding practice in Domestic animals
Bằng: Manjit Panigrahi, et al.
Được phát hành: (2012-01-01)

The need for research-based tools for personnel selection and assessment in the forensic sciences
Bằng: Randall D. Spain, et al.
Được phát hành: (2022-01-01)

From Microbial Genomics to Metagenomics
Bằng: Ravi Kant, et al.
Được phát hành: (2020-01-01)

Microbial genomics challenge Darwin
Bằng: Didier eRaoult, et al.
Được phát hành: (2012-10-01)

Microbial genomics and the periodic table/
Bằng: Wackett, Lawrence P., et al.

Genomics and evolution of microbial eukaryotes /
Bằng: Katz, Laura A., et al.
Được phát hành: (2006)

Specialized microbial databases for inductive exploration of microbial genome sequences
Bằng: Cabau Cédric, et al.
Được phát hành: (2005-02-01)

Detecting positive selection from genome scans of linkage disequilibrium
Bằng: Rogers Alan R, et al.
Được phát hành: (2010-01-01)

Detecting co-selection through excess linkage disequilibrium in bacterial genomes
Bằng: Mallawaarachchi, S, et al.
Được phát hành: (2024)

The importance of genome sequence quality to microbial comparative genomics
Bằng: Theo H. M. Smits
Được phát hành: (2019-08-01)