Joint modelling of diffusion MRI and microscopy

Joint modelling of diffusion MRI and microscopy

The combination of diffusion MRI with microscopy provides unique opportunities to study microstructural features of tissue, particularly when acquired in the same sample. Microscopy is frequently used to validate diffusion MRI microstructure models, addressing the indirect nature of dMRI signals. Ty...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Howard, A, Mollink, J, Kleinnijenhuis, M, Pallebage-Gamarallage, M, Bastiani, M, Cottaar, M, Miller, K, Jbabdi, S
Формат:	Journal article
Опубліковано:	Elsevier 2019

Схожі ресурси

Diffusion MRI fibre orientation dispersion estimates evaluated with polarized light imaging and histological analysis
за авторством: Mollink, J, та інші
Опубліковано: (2017)

Evaluating fibre orientation dispersion in white matter: Comparison of diffusion MRI, histology and polarized light imaging.
за авторством: Mollink, J, та інші
Опубліковано: (2017)

An open resource combining multi-contrast MRI and microscopy in the macaque brain
за авторством: Howard, AFD, та інші
Опубліковано: (2023)

An automated pipeline for extracting histological stain area fraction for voxelwise quantitative MRI-histology comparisons
за авторством: Kor, DZL, та інші
Опубліковано: (2022)

Choice of reference measurements affects quantification of long diffusion time behaviour using stimulated echoes
за авторством: Kleinnijenhuis, M, та інші
Опубліковано: (2017)

Automated quality control for within and between studies diffusion MRI data using a non-parametric framework for movement and distortion correction
за авторством: Bastiani, M, та інші
Опубліковано: (2018)

Estimating axial diffusivity in the NODDI model
за авторством: Howard, AF, та інші
Опубліковано: (2022)

An open resource combining multi-contrast MRI and microscopy in the macaque brain
за авторством: Amy F. D. Howard, та інші
Опубліковано: (2023-07-01)

Dissecting the pathobiology of altered MRI signal in amyotrophic lateral sclerosis: A post mortem whole brain sampling strategy for the integration of ultra-high-field MRI and quantitative neuropathology
за авторством: Pallebage-Gamarallage, M, та інші
Опубліковано: (2018)

Modelling an equivalent b-value in diffusion-weighted steady-state free precession
за авторством: Tendler, B, та інші
Опубліковано: (2020)

Microstructure imaging with diffusion MRI and microscopy
за авторством: Howard, A
Опубліковано: (2020)

Dentatorubrothalamic tract localization with postmortem MR diffusion tractography compared to histological 3D reconstruction.
за авторством: Mollink, J, та інші
Опубліковано: (2015)

An automated pipeline for extracting histological stain area fraction for voxelwise quantitative MRI-histology comparisons
за авторством: Daniel Z.L. Kor, та інші
Опубліковано: (2022-12-01)

Estimating axial diffusivity in the NODDI model
за авторством: Amy FD Howard, та інші
Опубліковано: (2022-11-01)

Identifying microstructural changes in diffusion MRI; How to circumvent parameter degeneracy
за авторством: Hossein Rafipoor, та інші
Опубліковано: (2022-10-01)

Quantifying myelin in crossing fibers using diffusion-prepared phase imaging: theory and simulations
за авторством: Cottaar, M, та інші
Опубліковано: (2021)

White matter changes in the perforant path area in patients with amyotrophic lateral sclerosis
за авторством: Mollink, J, та інші
Опубліковано: (2019)

Modelling fibre fanning in diffusion-weighted MRI.
за авторством: Sotiropoulos, SN, та інші
Опубліковано: (2012)

Diffusion tensor characteristics of gyrencephaly using high resolution diffusion MRI in vivo at 7T.
за авторством: Kleinnijenhuis, M, та інші
Опубліковано: (2015)

Modelling white matter in gyral blades as a continuous vector field
за авторством: Cottaar, M, та інші
Опубліковано: (2020)

Dissecting the pathobiology of altered MRI signal in amyotrophic lateral sclerosis: A post mortem whole brain sampling strategy for the integration of ultra-high-field MRI and quantitative neuropathology
за авторством: Menuka Pallebage-Gamarallage, та інші
Опубліковано: (2018-03-01)

Methods for quantitative susceptibility and R2* mapping in whole post-mortem brains at 7T applied to amyotrophic lateral sclerosis
за авторством: Wang, C, та інші
Опубліковано: (2020)

Functional and diffusion MRI reveal the neurophysiological basis of neonates’ noxious-stimulus evoked brain activity
за авторством: Baxter, L, та інші
Опубліковано: (2021)

The spatial correspondence and genetic influence of interhemispheric connectivity with white matter microstructure
за авторством: Mollink, J, та інші
Опубліковано: (2019)

The spatial correspondence and genetic influence of interhemispheric connectivity with white matter microstructure
за авторством: Mollink, J, та інші
Опубліковано: (2019)

Tensor image registration library: Deformable registration of stand‐alone histology images to whole‐brain post‐mortem MRI data
за авторством: Istvan N. Huszar, та інші
Опубліковано: (2023-01-01)

A gyral coordinate system predictive of fibre orientations
за авторством: Cottaar, M, та інші
Опубліковано: (2018)

Use of multi-flip angle measurements to account for transmit inhomogeneity and non-Gaussian diffusion in DW-SSFP.
за авторством: Tendler, BC, та інші
Опубліковано: (2020)

Improved fibre dispersion estimation using b-tensor encoding
за авторством: Cottaar, M, та інші
Опубліковано: (2020)

Improved tractography using asymmetric fibre orientation distributions
за авторством: Bastiani, M, та інші
Опубліковано: (2017)

Automated processing pipeline for neonatal diffusion MRI in the developing Human Connectome Project
за авторством: Bastiani, M, та інші
Опубліковано: (2018)

Cross-Subject Comparison of Local Diffusion MRI Parameters
за авторством: Smith, S, та інші
Опубліковано: (2013)

Connectivity-based segmentation of the periaqueductal gray matter in human with brainstem optimized diffusion MRI.
за авторством: Ezra, M, та інші
Опубліковано: (2014)

Structure Tensor Informed Fiber Tractography (STIFT) by combining gradient echo MRI and diffusion weighted imaging.
за авторством: Kleinnijenhuis, M, та інші
Опубліковано: (2012)

A method to remove the influence of fixative concentration on postmortem T2 maps using a kinetic tensor model
за авторством: Tendler, BC, та інші
Опубліковано: (2021)

RubiX: combining spatial resolutions for Bayesian inference of crossing fibers in diffusion MRI.
за авторством: Sotiropoulos, SN, та інші
Опубліковано: (2013)

Ball and rackets: Inferring fiber fanning from diffusion-weighted MRI.
за авторством: Sotiropoulos, SN, та інші
Опубліковано: (2012)

Human cortical connectome reconstruction from diffusion weighted MRI: the effect of tractography algorithm.
за авторством: Bastiani, M, та інші
Опубліковано: (2012)

Functional and diffusion MRI reveal the neurophysiological basis of neonates’ noxious-stimulus evoked brain activity
за авторством: Luke Baxter, та інші
Опубліковано: (2021-05-01)

Using GPUs to accelerate computational diffusion MRI: From microstructure estimation to tractography and connectomes
за авторством: Hernandez-Fernandez, M, та інші
Опубліковано: (2018)