Joint modelling of diffusion MRI and microscopy

Joint modelling of diffusion MRI and microscopy

The combination of diffusion MRI with microscopy provides unique opportunities to study microstructural features of tissue, particularly when acquired in the same sample. Microscopy is frequently used to validate diffusion MRI microstructure models, addressing the indirect nature of dMRI signals. Ty...

תיאור מלא

מידע ביבליוגרפי
Main Authors:	Howard, A, Mollink, J, Kleinnijenhuis, M, Pallebage-Gamarallage, M, Bastiani, M, Cottaar, M, Miller, K, Jbabdi, S
פורמט:	Journal article
יצא לאור:	Elsevier 2019

פריטים דומים

Diffusion MRI fibre orientation dispersion estimates evaluated with polarized light imaging and histological analysis
מאת: Mollink, J, et al.
יצא לאור: (2017)

Evaluating fibre orientation dispersion in white matter: Comparison of diffusion MRI, histology and polarized light imaging.
מאת: Mollink, J, et al.
יצא לאור: (2017)

An open resource combining multi-contrast MRI and microscopy in the macaque brain
מאת: Howard, AFD, et al.
יצא לאור: (2023)

An automated pipeline for extracting histological stain area fraction for voxelwise quantitative MRI-histology comparisons
מאת: Kor, DZL, et al.
יצא לאור: (2022)

Choice of reference measurements affects quantification of long diffusion time behaviour using stimulated echoes
מאת: Kleinnijenhuis, M, et al.
יצא לאור: (2017)

Automated quality control for within and between studies diffusion MRI data using a non-parametric framework for movement and distortion correction
מאת: Bastiani, M, et al.
יצא לאור: (2018)

Estimating axial diffusivity in the NODDI model
מאת: Howard, AF, et al.
יצא לאור: (2022)

An open resource combining multi-contrast MRI and microscopy in the macaque brain
מאת: Amy F. D. Howard, et al.
יצא לאור: (2023-07-01)

Dissecting the pathobiology of altered MRI signal in amyotrophic lateral sclerosis: A post mortem whole brain sampling strategy for the integration of ultra-high-field MRI and quantitative neuropathology
מאת: Pallebage-Gamarallage, M, et al.
יצא לאור: (2018)

Modelling an equivalent b-value in diffusion-weighted steady-state free precession
מאת: Tendler, B, et al.
יצא לאור: (2020)

Microstructure imaging with diffusion MRI and microscopy
מאת: Howard, A
יצא לאור: (2020)

Dentatorubrothalamic tract localization with postmortem MR diffusion tractography compared to histological 3D reconstruction.
מאת: Mollink, J, et al.
יצא לאור: (2015)

An automated pipeline for extracting histological stain area fraction for voxelwise quantitative MRI-histology comparisons
מאת: Daniel Z.L. Kor, et al.
יצא לאור: (2022-12-01)

Estimating axial diffusivity in the NODDI model
מאת: Amy FD Howard, et al.
יצא לאור: (2022-11-01)

Identifying microstructural changes in diffusion MRI; How to circumvent parameter degeneracy
מאת: Hossein Rafipoor, et al.
יצא לאור: (2022-10-01)

Quantifying myelin in crossing fibers using diffusion-prepared phase imaging: theory and simulations
מאת: Cottaar, M, et al.
יצא לאור: (2021)

White matter changes in the perforant path area in patients with amyotrophic lateral sclerosis
מאת: Mollink, J, et al.
יצא לאור: (2019)

Modelling fibre fanning in diffusion-weighted MRI.
מאת: Sotiropoulos, SN, et al.
יצא לאור: (2012)

Diffusion tensor characteristics of gyrencephaly using high resolution diffusion MRI in vivo at 7T.
מאת: Kleinnijenhuis, M, et al.
יצא לאור: (2015)

Modelling white matter in gyral blades as a continuous vector field
מאת: Cottaar, M, et al.
יצא לאור: (2020)

Dissecting the pathobiology of altered MRI signal in amyotrophic lateral sclerosis: A post mortem whole brain sampling strategy for the integration of ultra-high-field MRI and quantitative neuropathology
מאת: Menuka Pallebage-Gamarallage, et al.
יצא לאור: (2018-03-01)

Methods for quantitative susceptibility and R2* mapping in whole post-mortem brains at 7T applied to amyotrophic lateral sclerosis
מאת: Wang, C, et al.
יצא לאור: (2020)

Functional and diffusion MRI reveal the neurophysiological basis of neonates’ noxious-stimulus evoked brain activity
מאת: Baxter, L, et al.
יצא לאור: (2021)

The spatial correspondence and genetic influence of interhemispheric connectivity with white matter microstructure
מאת: Mollink, J, et al.
יצא לאור: (2019)

The spatial correspondence and genetic influence of interhemispheric connectivity with white matter microstructure
מאת: Mollink, J, et al.
יצא לאור: (2019)

Tensor image registration library: Deformable registration of stand‐alone histology images to whole‐brain post‐mortem MRI data
מאת: Istvan N. Huszar, et al.
יצא לאור: (2023-01-01)

A gyral coordinate system predictive of fibre orientations
מאת: Cottaar, M, et al.
יצא לאור: (2018)

Use of multi-flip angle measurements to account for transmit inhomogeneity and non-Gaussian diffusion in DW-SSFP.
מאת: Tendler, BC, et al.
יצא לאור: (2020)

Improved fibre dispersion estimation using b-tensor encoding
מאת: Cottaar, M, et al.
יצא לאור: (2020)

Improved tractography using asymmetric fibre orientation distributions
מאת: Bastiani, M, et al.
יצא לאור: (2017)

Automated processing pipeline for neonatal diffusion MRI in the developing Human Connectome Project
מאת: Bastiani, M, et al.
יצא לאור: (2018)

Cross-Subject Comparison of Local Diffusion MRI Parameters
מאת: Smith, S, et al.
יצא לאור: (2013)

Connectivity-based segmentation of the periaqueductal gray matter in human with brainstem optimized diffusion MRI.
מאת: Ezra, M, et al.
יצא לאור: (2014)

Structure Tensor Informed Fiber Tractography (STIFT) by combining gradient echo MRI and diffusion weighted imaging.
מאת: Kleinnijenhuis, M, et al.
יצא לאור: (2012)

A method to remove the influence of fixative concentration on postmortem T2 maps using a kinetic tensor model
מאת: Tendler, BC, et al.
יצא לאור: (2021)

RubiX: combining spatial resolutions for Bayesian inference of crossing fibers in diffusion MRI.
מאת: Sotiropoulos, SN, et al.
יצא לאור: (2013)

Ball and rackets: Inferring fiber fanning from diffusion-weighted MRI.
מאת: Sotiropoulos, SN, et al.
יצא לאור: (2012)

Human cortical connectome reconstruction from diffusion weighted MRI: the effect of tractography algorithm.
מאת: Bastiani, M, et al.
יצא לאור: (2012)

Functional and diffusion MRI reveal the neurophysiological basis of neonates’ noxious-stimulus evoked brain activity
מאת: Luke Baxter, et al.
יצא לאור: (2021-05-01)

Using GPUs to accelerate computational diffusion MRI: From microstructure estimation to tractography and connectomes
מאת: Hernandez-Fernandez, M, et al.
יצא לאור: (2018)