An improved method for quantitative ChIP studies of nuclear receptor function

An improved method for quantitative ChIP studies of nuclear receptor function

Chromatin immunoprecipitation (ChIP) is a valuable tool for the endocrine researcher, providing a means to measure the recruitment of hormone-activated nuclear receptors, for example. However, the technique can be challenging to perform and has multiple experimental steps, risking introduction of er...

Detaylı Bibliyografya
Asıl Yazarlar:	Hunter, A, Narang, N, Baxter, M, Ray, D, Poolman, T
Materyal Türü:	Journal article
Baskı/Yayın Bilgisi:	Bioscientifica 2019

Benzer Materyaller

Impact of artefact removal on ChIP quality metrics in ChIP-seq and ChIP-exo data.
Yazar:: Thomas Samuel Carroll, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014-04-01)

Comparison of sample preparation methods for ChIP-chip assays
Yazar:: Henriette O'Geen, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2006-11-01)

Analysis of the mouse embryonic stem cell regulatory networks obtained by ChIP-chip and ChIP-PET
Yazar:: Mathur, Divya, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

Impact of genome assembly status on ChIP-Seq and ChIP-PET data mapping
Yazar:: Sachs Laurent, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009-12-01)

Fish the ChIPs: a pipeline for automated genomic annotation of ChIP-Seq data
Yazar:: Minucci Saverio, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011-10-01)

Quantitative ChIP-seq by Adding Spike-in from Another Species
Yazar:: Kongyan Niu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018-08-01)

A Computational Model of Quantitative Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Analysis
Yazar:: Stephen J. Brandt, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008-01-01)

Epigenomic profiling of archived FFPE tissues by enhanced PAT-ChIP (EPAT-ChIP) technology
Yazar:: Stefano Amatori, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018-11-01)

ChIP-Seq in Candida albicans
Yazar:: Sadri Znaidi, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014-06-01)

Simplified ChIP-exo assays
Yazar:: Matthew J. Rossi, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018-07-01)

An integrated workflow for analysis of ChIP-chip data
Yazar:: Karin Weigelt, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008-08-01)

Optimising oligonucleotide array design for ChIP-on-chip
Yazar:: Birney Ewan, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007-11-01)

Normalization and experimental design for ChIP-chip data
Yazar:: Alekseyenko Artyom A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007-06-01)

ChIP on Chip: surprising results are often artifacts
Yazar:: Skarstad Kirsten, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010-07-01)

Analyzing ChIP-chip data using bioconductor.
Yazar:: Joern Toedling, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008-11-01)

Probing the cohesin loading reaction using forward genetics and quantitative ChIP-sequencing
Yazar:: Petela, N
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

ChIPseqR: analysis of ChIP-seq experiments
Yazar:: Helliwell Chris A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011-01-01)

De novo ChIP-seq analysis
Yazar:: He, Xin, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Dual agarose magnetic (DAM) ChIP
Yazar:: Balakrishnan Lata, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009-12-01)

Modeling ChIP sequencing in silico with applications.
Yazar:: Zhengdong D Zhang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008-08-01)

Identification of ChIP-seq and RIME grade antibodies for Estrogen Receptor alpha.
Yazar:: Silvia-E Glont, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019-01-01)

Shape-based peak identification for ChIP-Seq
Yazar:: Evans Steven N, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011-01-01)

A widespread distribution of genomic CeMyoD binding sites revealed and cross validated by ChIP-Chip and ChIP-Seq techniques.
Yazar:: Haiyan Lei, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010-12-01)

ChIPulate: A comprehensive ChIP-seq simulation pipeline.
Yazar:: Vishaka Datta, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019-03-01)

Ringo – an R/Bioconductor package for analyzing ChIP-chip readouts
Yazar:: Huber Wolfgang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007-06-01)

Parameter estimation for robust HMM analysis of ChIP-chip data
Yazar:: Humburg Peter, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008-08-01)

Bayesian modeling of ChIP-chip data using latent variables
Yazar:: Tian Yanan, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009-10-01)

Quantized correlation coefficient for measuring reproducibility of ChIP-chip data
Yazar:: Kuroda Mitzi I, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010-07-01)

aFARP-ChIP-seq, a convenient and reliable method for genome profiling in as few as 100 cells with a capability for multiplexing ChIP-seq
Yazar:: Wenbin Liu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019-09-01)

A flexible ChIP-sequencing simulation toolkit
Yazar:: Zheng, An, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

Model-based Analysis of ChIP-Seq (MACS)
Yazar:: Zhang, Yong, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

In silico pooling of ChIP-seq control experiments.
Yazar:: Guannan Sun, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014-01-01)

CATCHprofiles: clustering and alignment tool for ChIP profiles.
Yazar:: Fiona G G Nielsen, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012-01-01)

HaloChIP-seq for Antibody-Independent Mapping of Mouse Transcription Factor Cistromes in vivo
Yazar:: Ann Louise Hunter, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-07-01)

Improvement of the Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Assay by DNA Fragment Size Fractionation
Yazar:: Trina A. Johnson, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2001-10-01)

The Triform algorithm: improved sensitivity and specificity in ChIP-Seq peak finding
Yazar:: Kornacker Karl, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012-07-01)

WACS: improving ChIP-seq peak calling by optimally weighting controls
Yazar:: Aseel Awdeh, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-02-01)

Starr: Simple Tiling ARRay analysis of Affymetrix ChIP-chip data
Yazar:: Tresch Achim, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010-04-01)

Identification of thyroid hormone receptor binding sites and target genes using ChIP-on-chip in developing mouse cerebellum.
Yazar:: Hongyan Dong, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009-01-01)

A Brazilian version of the "Children's Interview for Psychiatric Syndromes" (ChIPS) A versão brasileira do "Children's Interview for Psychiatric Syndromes" (ChIPS)
Yazar:: Isabella G. S. de Souza, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009-01-01)