Inferring genomic flux in bacteria.

Inferring genomic flux in bacteria.

Acquisition and loss of genetic material are essential forces in bacterial microevolution. They have been repeatedly linked with adaptation of lineages to new lifestyles, and in particular, pathogenicity. Comparative genomics has the potential to elucidate this genetic flux, but there are many metho...

Podrobná bibliografie
Hlavní autoři:	Didelot, X, Darling, A, Falush, D
Médium:	Journal article
Jazyk:	English
Vydáno:	2009

Podobné jednotky

Inference of homologous recombination in bacteria using whole-genome sequences.
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2010)

Inference of bacterial microevolution using multilocus sequence data.
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2007)

Impact of homologous and non-homologous recombination in the genomic evolution of Escherichia coli
Autor: Didelot Xavier, a další
Vydáno: (2012-06-01)

ClonalFrameML: efficient inference of recombination in whole bacterial genomes
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2015)

Genome-wide association mapping in bacteria?
Autor: Falush, D, a další
Vydáno: (2006)

Toward the use of genomics to study microevolutionary change in bacteria.
Autor: Daniel Falush
Vydáno: (2009-10-01)

A Bayesian approach to inferring the phylogenetic structure of communities from metagenomic data.
Autor: O'Brien, J, a další
Vydáno: (2014)

SimMLST: simulation of multi-locus sequence typing data under a neutral model.
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2009)

A bimodal pattern of relatedness between the Salmonella Paratyphi A and Typhi genomes: convergence or divergence by homologous recombination?
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2007)

ClonalFrameML: efficient inference of recombination in whole bacterial genomes.
Autor: Xavier Didelot, a další
Vydáno: (2015-02-01)

Genealogical typing of Neisseria meningitidis.
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2009)

Evolution of pathogenicity in the Bacillus cereus group.
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2009)

Genome plasticity during chronic infection with H-pylori
Autor: Kennemann, L, a další
Vydáno: (2008)

Bayesian inference of the evolution of a phenotype distribution on a phylogenetic tree
Autor: Ansari, M, a další
Vydáno: (2016)

Epistasis, core-genome disharmony, and adaptation in recombining bacteria
Autor: Taylor, AJ, a další
Vydáno: (2024)

Inference of recombination properties in bacteria from whole genomes
Autor: Ansari, M
Vydáno: (2014)

Inference of population structure using dense haplotype data.
Autor: Lawson, D, a další
Vydáno: (2012)

Mosaic DNA imports with interspersions of recipient sequence after natural transformation of Helicobacter pylori.
Autor: Kulick, S, a další
Vydáno: (2008)

A comparison of homologous recombination rates in bacteria and archaea.
Autor: Vos, M, a další
Vydáno: (2009)

Helicobacter pylori genome evolution during human infection.
Autor: Kennemann, L, a další
Vydáno: (2011)

Inferring human colonization history using a copying model.
Autor: Garrett Hellenthal, a další
Vydáno: (2008-05-01)

Mismatch induced speciation in Salmonella: model and data.
Autor: Falush, D, a další
Vydáno: (2006)

Correction: Inferring Human Colonization History Using a Copying Model.
Autor: Garrett Hellenthal, a další
Vydáno: (2008-06-01)

Inference and prediction of metabolic network fluxes.
Autor: Nikoloski, Z, a další
Vydáno: (2015)

Bayesian inference of ancestral dates on bacterial phylogenetic trees
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2018)

Inference of population structure using dense haplotype data.
Autor: Daniel John Lawson, a další
Vydáno: (2012-01-01)

Epistasis, core-genome disharmony, and adaptation in recombining bacteria
Autor: Aidan J. Taylor, a další
Vydáno: (2024-06-01)

Sequencing of seven haloarchaeal genomes reveals patterns of genomic flux.
Autor: Erin A Lynch, a další
Vydáno: (2012-01-01)

Germs, genomes and genealogies.
Autor: Wilson, D, a další
Vydáno: (2005)

Microevolution of Helicobacter pylori during prolonged infection of single hosts and within families.
Autor: Morelli, G, a další
Vydáno: (2010)

An examination of speciation in recombining bacteria: The relationship between Campylobacter jejuni and Campylobacter coli
Autor: Sheppard, S, a další
Vydáno: (2007)

Interplay of recombination and selection in the genomes of Chlamydia trachomatis.
Autor: Joseph, S, a další
Vydáno: (2011)

Progressive genome-wide introgression in agricultural Campylobacter coli.
Autor: Sheppard, S, a další
Vydáno: (2013)

Transforming clinical microbiology with bacterial genome sequencing.
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2012)

Inferred basal friction and mass flux affected by crystal-orientation fabrics
Autor: Nicholas M. Rathmann, a další
Vydáno: (2022-04-01)

SimBac: simulation of whole bacterial genomes with homologous recombination
Autor: Didelot, X, a další
Vydáno: (2015)

Colistin resistance in Gram-negative bacteria analysed by five phenotypic assays and inference of the underlying genomic mechanisms
Autor: Diana Albertos Torres, a další
Vydáno: (2021-11-01)

Fidelity of hyperbolic space for Bayesian phylogenetic inference.
Autor: Matthew Macaulay, a další
Vydáno: (2023-04-01)

Simultaneous inference of phylogenetic and transmission trees in infectious disease outbreaks.
Autor: Don Klinkenberg, a další
Vydáno: (2017-05-01)

Progressive genome-wide introgression in agricultural Campylobacter coli
Autor: Sheppard, S, a další
Vydáno: (2013)