Nucleobase recognition in ssDNA at the central constriction of the alpha-hemolysin pore.

Nucleobase recognition in ssDNA at the central constriction of the alpha-hemolysin pore.

Nanopores are under investigation for single-molecule DNA sequencing. The alpha-hemolysin (alphaHL) protein nanopore contains three recognition points capable of nucleobase discrimination in individual immobilized ssDNA molecules. We have modified the recognition point R(1) by extensive mutagenesis...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Stoddart, D, Heron, A, Klingelhoefer, J, Mikhailova, E, Maglia, G, Bayley, H
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2010

Những quyển sách tương tự

Enhanced translocation of single DNA molecules through alpha-hemolysin nanopores by manipulation of internal charge.
Bằng: Maglia, G, et al.
Được phát hành: (2008)

Nucleobase recognition at alkaline pH and apparent pKa of single DNA bases immobilised within a biological nanopore.
Bằng: Franceschini, L, et al.
Được phát hành: (2012)

Fluorinated amphiphiles control the insertion of α-hemolysin pores into lipid bilayers.
Bằng: Raychaudhuri, P, et al.
Được phát hành: (2011)

Urea facilitates the translocation of single-stranded DNA and RNA through the alpha-hemolysin nanopore.
Bằng: Japrung, D, et al.
Được phát hành: (2010)

Structure of staphylococcal alpha-hemolysin, a heptameric transmembrane pore.
Bằng: Song, L, et al.
Được phát hành: (1996)

Expression of ssDNA in Mammalian Cells
Bằng: Yin Chen, et al.
Được phát hành: (2003-01-01)

Assembly of the oligomeric membrane pore formed by Staphylococcal alpha-hemolysin examined by truncation mutagenesis.
Bằng: Walker, B, et al.
Được phát hành: (1992)

Structural Basis of SOSS1 Complex Assembly and Recognition of ssDNA
Bằng: Wendan Ren, et al.
Được phát hành: (2014-03-01)

Multiple base-recognition sites in a biological nanopore: two heads are better than one.
Bằng: Stoddart, D, et al.
Được phát hành: (2010)

Single-nucleotide discrimination in immobilized DNA oligonucleotides with a biological nanopore.
Bằng: Stoddart, D, et al.
Được phát hành: (2009)

Surface labeling of key residues during assembly of the transmembrane pore formed by staphylococcal alpha-hemolysin.
Bằng: Krishnasastry, M, et al.
Được phát hành: (1994)

Subunit stoichiometry of staphylococcal alpha-hemolysin in crystals and on membranes: a heptameric transmembrane pore.
Bằng: Gouaux, J, et al.
Được phát hành: (1994)

Biotechnological production of ssDNA with DNA-hydrolyzing deoxyribozymes
Bằng: Jin Liu, et al.
Được phát hành: (2021-06-01)

RNase A does not translocate the alpha-hemolysin pore.
Bằng: Besnik Krasniqi, et al.
Được phát hành: (2014-01-01)

The internal cavity of the staphylococcal alpha-hemolysin pore accommodates approximately 175 exogenous amino acid residues.
Bằng: Jung, Y, et al.
Được phát hành: (2005)

Redirecting pore assembly of staphylococcal α-hemolysin by protein engineering
Bằng: Koo, S, et al.
Được phát hành: (2019)

Structure, stability and specificity of the binding of ssDNA and ssRNA with proteins.
Bằng: Arumay Pal, et al.
Được phát hành: (2019-04-01)

Studying the recognition mechanism of TcaR and ssDNA using molecular dynamic simulations
Bằng: Fan, Jing-rong, et al.
Được phát hành: (2020)

Imaging the assembly of the Staphylococcal pore-forming toxin alpha-Hemolysin
Bằng: Thompson, J, et al.
Được phát hành: (2009)

Single-molecule chemistry studies with engineered alpha-hemolysin pores
Bằng: Hammerstein, A
Được phát hành: (2011)

Redirecting Pore Assembly of Staphylococcal α‑Hemolysin by Protein Engineering
Bằng: Sunwoo Koo, et al.
Được phát hành: (2019-03-01)

Identification of epigenetic DNA modifications with a protein nanopore.
Bằng: Wallace, E, et al.
Được phát hành: (2010)

Properties of Bacillus cereus hemolysin II: a heptameric transmembrane pore.
Bằng: Miles, G, et al.
Được phát hành: (2002)

Proof of ssDNA degraded from dsDNA for ET recombination
Bằng: Yuanxia Zheng, et al.
Được phát hành: (2024-09-01)

Selection and Identification of an ssDNA Aptamer for Fibroblast Activation Protein
Bằng: Xiaomin Zhang, et al.
Được phát hành: (2023-02-01)

Computational Study on the Interaction and Moving of ssDNA through Nanosheets
Bằng: Mansoor H. Alshehri
Được phát hành: (2021-08-01)

Selection, Characterization, and Application of ssDNA Aptamer against Furaneol
Bằng: Natalia Komarova, et al.
Được phát hành: (2018-11-01)

Selection and targeting of EpCAM protein by ssDNA aptamer.
Bằng: Walhan Alshaer, et al.
Được phát hành: (2017-01-01)

Key residues for membrane binding, oligomerization, and pore forming activity of staphylococcal alpha-hemolysin identified by cysteine scanning mutagenesis and targeted chemical modification.
Bằng: Walker, B, et al.
Được phát hành: (1995)

Interactions between residues in staphylococcal alpha-hemolysin revealed by reversion mutagenesis.
Bằng: Panchal, R, et al.
Được phát hành: (1995)

Watson-Crick Base-Pairing Requirements for ssDNA Recognition and Processing in Replication-Initiating HUH Endonucleases
Bằng: Adam T. Smiley, et al.
Được phát hành: (2023-02-01)

Deciphering the mechanism of processive ssDNA digestion by the Dna2-RPA ensemble
Bằng: Jiangchuan Shen, et al.
Được phát hành: (2022-01-01)

Physiological Tolerance to ssDNA Enables Strand Uncoupling during DNA Replication
Bằng: Amaia Ercilla, et al.
Được phát hành: (2020-02-01)

Electric-field-driven translocation of ssDNA through hydrophobic nanopores
Bằng: Haynes, T, et al.
Được phát hành: (2018)

Systematic Selection of High‐Affinity ssDNA Sequences to Carbon Nanotubes
Bằng: Dakyeon Lee, et al.
Được phát hành: (2024-08-01)

CRISPR/Cas9‐enhanced ssDNA recombineering for Pseudomonas putida
Bằng: Tomás Aparicio, et al.
Được phát hành: (2019-09-01)

Correction: Selection and targeting of EpCAM protein by ssDNA aptamer.
Bằng: Walhan Alshaer, et al.
Được phát hành: (2018-01-01)

Development of a novel, high-affinity ssDNA trypsin inhibitor
Bằng: Stanislaw Malicki, et al.
Được phát hành: (2019-01-01)

Generation of ssDNA aptamers as diagnostic tool for Newcastle avian virus.
Bằng: Boutheina Marnissi, et al.
Được phát hành: (2020-01-01)

Dual functions for the ssDNA-binding protein RPA in meiotic recombination.
Bằng: Baolu Shi, et al.
Được phát hành: (2019-02-01)