Automatic assignment of methyl resonances using experimental NMR data and graph theory

Automatic assignment of methyl resonances using experimental NMR data and graph theory

<p>Selective isotope labeling of methyl groups allows for atomic-resolution insight into the structures and dynamics of high molecular mass proteins by nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. Widespread application of the methodology has been limited due to the challenges and costs asso...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автор:	Pritišanac, I
Інші автори:	Baldwin, A
Формат:	Дисертація
Мова:	English
Опубліковано:	2016

Схожі ресурси

Automatic assignment of methyl-NMR spectra of supra-molecular machines using graph theory
за авторством: Pritisanac, I, та інші
Опубліковано: (2017)

Automatic structure-based NMR methyl resonance assignment in large proteins
за авторством: Iva Pritišanac, та інші
Опубліковано: (2019-10-01)

Backbone-independent NMR resonance assignments of methyl probes in large proteins
за авторством: Santrupti Nerli, та інші
Опубліковано: (2021-01-01)

Automated Projection Spectroscopy (APSY) for the Assignment of NMR Resonances of Biological Macromolecules
за авторством: Barbara Krähenbühl, та інші
Опубліковано: (2012-10-01)

Assignment of protein NMR spectra using heteronuclear NMR: a tutorial
за авторством: Redfield, C
Опубліковано: (2015)

Assigning backbone NMR resonances for full length tau isoforms: efficient compromise between manual assignments and reduced dimensionality.
за авторством: Nicholas W Harbison, та інші
Опубліковано: (2012-01-01)

Robust automated backbone triple resonance NMR assignments of proteins using Bayesian-based simulated annealing
за авторством: Anthony C. Bishop, та інші
Опубліковано: (2023-03-01)

Automated NMR resonance assignments and structure determination using a minimal set of 4D spectra
за авторством: Thomas Evangelidis, та інші
Опубліковано: (2018-01-01)

Towards resolving the complex paramagnetic nuclear magnetic resonance (NMR) spectrum of small laccase: assignments of resonances to residue-specific nuclei
за авторством: R. Dasgupta, та інші
Опубліковано: (2021-01-01)

NMReDATA, a standard to report the NMR assignment and parameters of organic compounds
за авторством: Pupier, M, та інші
Опубліковано: (2018)

Complete Assignments of NMR Spectral Data of Three C19-Diterpenoid Alkaloids
за авторством: YIN Tian-peng, та інші
Опубліковано: (2019-09-01)

An algorithm based on the graph theory for solving the time-criterion assignement problem
за авторством: R. Avram-Niţchi
Опубліковано: (1984-08-01)

An algorithm based on the graph theory for solving the time-criterion assignement problem
за авторством: R. Avram-Niţchi
Опубліковано: (1984-08-01)

Robust, integrated computational control of NMR experiments to achieve optimal assignment by ADAPT-NMR.
за авторством: Arash Bahrami, та інші
Опубліковано: (2012-01-01)

Graph neural network based approach to automatically assigning common weakness enumeration identifiers for vulnerabilities
за авторством: Peng Liu, та інші
Опубліковано: (2023-11-01)

Backbone Assignment of the MALT1 Paracaspase by Solution NMR.
за авторством: Sofia Unnerståle, та інші
Опубліковано: (2016-01-01)

Two-dimensional 19F–13C correlation NMR for 19F resonance assignment of fluorinated proteins
за авторством: Shcherbakov, Alexander A, та інші
Опубліковано: (2021)

Efficient resonance assignment of proteins in MAS NMR by simultaneous intra- and inter-residue 3D correlation spectroscopy
за авторством: Daviso, Eugenio, та інші
Опубліковано: (2015)

Automatic assignment of EC numbers.
за авторством: Volker Egelhofer, та інші
Опубліковано: (2010-01-01)

Flight Level Assignment Using Graph Coloring
за авторством: Jose Manuel Gimenez-Guzman, та інші
Опубліковано: (2020-09-01)

Flight level assignment using graph coloring
за авторством: Gimenez-Guzman, Jose Manuel, та інші
Опубліковано: (2020)

1D and 2D NMR datasets, resonance assignments and coupling constant analysis of red beet fiber and pectin
за авторством: Gary D. Strahan, та інші
Опубліковано: (2023-02-01)

Strategies for RNA Resonance Assignment by 13C/15N- and 1H-Detected Solid-State NMR Spectroscopy
за авторством: Philipp Innig Aguion, та інші
Опубліковано: (2021-10-01)

NMR Assignment of Methyl Groups in Immobilized Proteins Using Multiple-Bond 13C Homonuclear Transfers, Proton Detection, and Very Fast MAS
за авторством: Piotr Paluch, та інші
Опубліковано: (2022-03-01)

Assignment of NMR spectral data of diastereomeric tetrahydrofuranyl acetals directly from their mixture by spectral simulation
за авторством: Nešić Milan S., та інші
Опубліковано: (2024-01-01)

POKY software tools encapsulating assignment strategies for solution and solid-state protein NMR data
за авторством: Ira Manthey, та інші
Опубліковано: (2022-01-01)

Assignments of NMR Spectral Data of a Novel Carbazole-Triazinoindole Based N-Acylhydrazone Derivative
за авторством: LI Ying-jun, та інші
Опубліковано: (2020-12-01)

Refining Kea++ automatic keyphrase assignment
за авторством: Irfan, R, та інші
Опубліковано: (2014)

Channel assignment on graphs of bounded treewidth.
за авторством: McDiarmid, C, та інші
Опубліковано: (2003)

An Attempt to Assign the NMR Spectra in 7-Methyl-and 7-Benzyl-substituted 7H-Purine 1-Oxides Using the ACD/Labs Software Package
за авторством: StanisÃ…Â‚aw Ostrowski
Опубліковано: (2003-08-01)

Generating experimental data for the generalized assignment problem
за авторством: Romero-Morales, D, та інші
Опубліковано: (2001)

Synthesis and 13C NMR chemical shift assignments of 2,2'-bipyridine-4,4'-dicarboxylates of bile acid methyl esters
за авторством: Jari T. Tamminen, та інші
Опубліковано: (2000-02-01)

Automatic Structural Synthesis of Planetary Geared Mechanisms ‎using Graph Theory
за авторством: Hind A. Nafeh, та інші
Опубліковано: (2023-04-01)

Theory of NMR parameters/
за авторством: 265386 Ando, I., та інші
Опубліковано: (1983)

Evaluation of Multi-Objective Optimization Algorithms for NMR Chemical Shift Assignment
за авторством: Emel Maden Yılmaz, та інші
Опубліковано: (2021-06-01)

Chemical shift transfer: an effective strategy for protein NMR assignment with ARTINA
за авторством: Henry Wetton, та інші
Опубліковано: (2023-10-01)

Isolation, purification, and full NMR assignments of cyclopamine from <it>Veratrum californicum</it>
за авторством: Gallien Thomas N, та інші
Опубліковано: (2008-06-01)

NMR assignments of ring-opened indole alkaloids from leuconotis species /
за авторством: 179111 Abdul Razak Mohd. Ali, та інші

Automatic pharmacophore model generation using weighted substructure assignments
за авторством: Jahn Andreas, та інші
Опубліковано: (2010-05-01)

Using Machine Learning Methods for Automatic Bug Assignment to Developers
за авторством: M. Yousefi, та інші
Опубліковано: (2020-07-01)