Coarse-grained modeling of DNA and DNA nanotechnology

Coarse-grained modeling of DNA and DNA nanotechnology

Detaylı Bibliyografya
Asıl Yazarlar:	Ouldridge, T, Sulc, P, Romano, F, Louis, A, Doye, J
Materyal Türü:	Conference item
Baskı/Yayın Bilgisi:	2012

Benzer Materyaller

Coarse-graining DNA for simulations of DNA nanotechnology.
Yazar:: Doye, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

Simulating a burnt-bridges DNA motor with a coarse-grained DNA model
Yazar:: Sulc, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Simulating a burnt-bridges DNA motor with a coarse-grained DNA model
Yazar:: Šulc, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)

Sequence-dependent thermodynamics of a coarse-grained DNA model.
Yazar:: Šulc, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Optimizing DNA nanotechnology through coarse-grained modeling: a two-footed DNA walker.
Yazar:: Ouldridge, T, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

DNA nanotweezers studied with a coarse-grained model of DNA.
Yazar:: Ouldridge, T, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

DNA nanotweezers studied with a coarse-grained model of DNA
Yazar:: Ouldridge, T, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

Coarse-grained simulations of DNA overstretching.
Yazar:: Romano, F, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

A nucleotide-level coarse-grained model of RNA
Yazar:: Šulc, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)

Structural, mechanical, and thermodynamic properties of a coarse-grained DNA model.
Yazar:: Ouldridge, T, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

Coarse-grained modelling of DNA-RNA hybrids
Yazar:: Ratajczyk, EJ, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023)

Identifying physical causes of apparent enhanced cyclization of short DNA molecules with a coarse-grained model
Yazar:: Harrison, R, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019)

Introducing improved structural properties and salt dependence into a coarse-grained model of DNA.
Yazar:: Snodin, B, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Multi-scale coarse-graining for the study of assembly pathways in DNA-brick self-assembly
Yazar:: Fonseca, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018)

Coarse-grained modelling of DNA and DNA self-assembly
Yazar:: Ouldridge, T
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

Coarse-grained modelling of the structural properties of DNA origami
Yazar:: Snodin, B, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019)

Free energy landscapes of DNA and its assemblies: perspectives from coarse-grained modelling
Yazar:: Doye, JPK, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Coarse-Grained Modelling of Extreme DNA Bending
Yazar:: Harrison, R, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)

DNA hybridization kinetics: zippering, internal displacement and sequence dependence.
Yazar:: Ouldridge, T, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

Characterizing the motion of jointed DNA nanostructures using a coarse-grained model
Yazar:: Sharma, R, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2017)

Coarse-grained modelling of supercoiled RNA
Yazar:: Matek, C, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Characterizing DNA Star-Tile-Based Nanostructures Using a Coarse-Grained Model.
Yazar:: Schreck, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

DNA hairpins primarily promote duplex melting rather than inhibiting hybridization
Yazar:: Schreck, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)

Characterizing the bending and flexibility induced by bulges in DNA duplexes.
Yazar:: Schreck, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

The role of loop stacking in the dynamics of DNA hairpin formation.
Yazar:: Mosayebi, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)

The effect of topology on the structure and free energy landscape of DNA kissing complexes.
Yazar:: Romano, F, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Plectoneme tip bubbles : coupled denaturation and writhing in supercoiled DNA
Yazar:: Matek, C, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Coarse-grained modelling of nucleic acids
Yazar:: Sulc, P
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014)

On the biophysics and kinetics of toehold-mediated DNA strand displacement
Yazar:: Srinivas, N, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

The self-assembly of DNA Holliday junctions studied with a minimal model
Yazar:: Ouldridge, T, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009)

Bottom-up coarse-grained modeling of DNA
Yazar:: Sun, Tiedong, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

Modelling toehold-mediated RNA strand displacement
Yazar:: Šulc, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Direct simulation of the self-assembly of a small DNA origami
Yazar:: Snodin, BEK, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

A Primer on the oxDNA Model of DNA: When to Use it, How to Simulate it and How to Interpret the Results
Yazar:: A. Sengar, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-06-01)

Simulating large DNA nanostructures with a coarse-grained model
Yazar:: Snodin, B
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

Coarse-grained modelling of a DNA origami force sensor
Yazar:: Sen, N
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

MARTINI-Based Protein-DNA Coarse-Grained HADDOCKing
Yazar:: Rodrigo V. Honorato, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019-10-01)

DNA cruciform arms nucleate through a correlated but asynchronous cooperative mechanism.
Yazar:: Matek, C, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Force-induced rupture of a DNA duplex: from fundamentals to force sensors
Yazar:: Mosayebi, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015)

Influence of ionic conditions on knotting in a coarse-grained model for DNA
Yazar:: Sarah Wettermann, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-01-01)