Electrostatics studies and molecular dynamics simulations of a homology model of the Shaker K+ channel pore.

Electrostatics studies and molecular dynamics simulations of a homology model of the Shaker K+ channel pore.

A homology model of the pore domain of the Shaker K+ channel has been constructed using a bacterial K+ channel, KcsA, as a template structure. The model is in agreement with mutagenesis and sequence variability data. A number of structural features are conserved between the two channels, including a...

সম্পূর্ণ বিবরণ

গ্রন্থ-পঞ্জীর বিবরন
প্রধান লেখক:	Ranatunga, K, Law, R, Smith, G, Sansom, MS
বিন্যাস:	Journal article
ভাষা:	English
প্রকাশিত:	2001

অনুরূপ উপাদানগুলি

Computational studies on a homology model of the Shaker K+ channel pore
অনুযায়ী: Ranatunga, K, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2000)

Homology modeling and molecular dynamics simulation studies of an inward rectifier potassium channel.
অনুযায়ী: Capener, C, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2000)

Interaction of Tc1 toxin with the Shaker K+-channel: a molecular dynamics simulation study.
অনুযায়ী: Grottesi, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2003)

Molecular dynamics simulations of the Shaker voltage-gated K+ channel: Open vs closed structural model
অনুযায়ী: Shrivastava, I, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

K+ channels - Homology models and and stimulations
অনুযায়ী: Sansom, M, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2000)

Conformational dynamics of helix S6 from Shaker potassium channel: simulation studies.
অনুযায়ী: Bright, J, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

Homology modelling and molecular dynamics simulations: comparative studies of human aquaporin-1.
অনুযায়ী: Law, R, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2004)

Structure and dynamics of K channel pore-lining helices: a comparative simulation study.
অনুযায়ী: Shrivastava, I, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2000)

The pore-lining region of shaker voltage-gated potassium channels: comparison of β-barrel and α-helix bundle models
অনুযায়ী: Kerr, I, অন্যান্য
প্রকাশিত: (1997)

Structure and dynamics of the pore-lining helix of the nicotinic receptor: MD simulations in water, lipid bilayers, and transbilayer bundles.
অনুযায়ী: Law, R, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2000)

The pore domain of the nicotinic acetylcholine receptor: molecular modeling, pore dimensions, and electrostatics
অনুযায়ী: Sankararamakrishnan, R, অন্যান্য
প্রকাশিত: (1996)

Pores formed by the nicotinic receptor m2delta Peptide: a molecular dynamics simulation study.
অনুযায়ী: Law, R, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2003)

Simulations of ion channels--watching ions and water move.
অনুযায়ী: Sansom, MS, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2000)

Molecular dynamics simulation approaches to K channels: conformational flexibility and physiological function.
অনুযায়ী: Grottesi, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2005)

Water in ion channels and pores--simulation studies.
অনুযায়ী: Sansom, MS, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

Simulations of potassium channel function: KcsA and homology models
অনুযায়ী: Sansom, M, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2000)

Research Progress on Plant Shaker K<sup>+</sup> Channels
অনুযায়ী: Guang Yuan, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-05-01)

Molecular dynamics simulations of a K+ channel blocker: Tc1 toxin from Tityus cambridgei.
অনুযায়ী: Grottesi, A, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2003)

Interactions of the pleckstrin homology domain with phosphatidylinositol phosphate and membranes: characterization via molecular dynamics simulations.
অনুযায়ী: Psachoulia, E, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

Molecular dynamics simulations and KcsA channel gating.
অনুযায়ী: Shrivastava, I, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

Molecular basis for functional connectivity between the voltage sensor and the selectivity filter gate in Shaker K+ channels
অনুযায়ী: Carlos AZ Bassetto, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-02-01)

Expanded functional diversity of shaker K(+) channels in cnidarians is driven by gene expansion.
অনুযায়ী: Timothy Jegla, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2012-01-01)

A prokaryotic glutamate receptor: homology modelling and molecular dynamics simulations of GluR0.
অনুযায়ী: Arinaminpathy, Y, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2003)

Side-chain ionization states in a potassium channel.
অনুযায়ী: Ranatunga, K, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2001)

Exploring possible gating mechanisms in voltage dependent K+ channels: Molecular dynamics simulation studies
অনুযায়ী: Sands, Z, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2005)

Potassium and sodium ions in a potassium channel studied by molecular dynamics simulations.
অনুযায়ী: Biggin, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2001)

Transmembrane domains of viral ion channel proteins: a molecular dynamics simulation study.
অনুযায়ী: Fischer, W, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2000)

Genome-wide identification of kiwifruit K+ channel Shaker family members and their response to low-K+ stress
অনুযায়ী: Yinqiang Zi, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-09-01)

Molecular dynamics simulations of a K channel model: Sensitivity to changes in ions, waters, and membrane environment
অনুযায়ী: Capener, C, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

The pore structure and gating mechanism of K2P channels.
অনুযায়ী: Piechotta, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2011)

Noncanonical mechanism of voltage sensor coupling to pore revealed by tandem dimers of Shaker
অনুযায়ী: João L. Carvalho-de-Souza, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019-08-01)

Homology modelling and molecular dynamics simulations of a prokaryotic glutamate receptor: GluR0
অনুযায়ী: Arinaminpathy, Y, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

Molecular modeling and simulation studies of ion channel structures, dynamics and mechanisms.
অনুযায়ী: Tai, K, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

The Molecular Basis of Polyunsaturated Fatty Acid Interactions with the Shaker Voltage-Gated Potassium Channel.
অনুযায়ী: Samira Yazdi, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2016-01-01)

Regulating Shaker Kv channel clustering by hetero-oligomerization
অনুযায়ী: Esraa Nsasra, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-01-01)

Conformational dynamics of the ligand-binding domain of inward rectifier K channels as revealed by molecular dynamics simulations: toward an understanding of Kir channel gating.
অনুযায়ী: Haider, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2005)

OmpA: a pore or not a pore? Simulation and modeling studies.
অনুযায়ী: Bond, P, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002)

Molecular dynamics simulations of inwardly rectifying (Kir) potassium channels: a comparative study.
অনুযায়ী: Haider, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2007)

Genome-Wide Identification and Characterization of the Shaker-Type K+ Channel Genes in Prunus persica (L.) Batsch
অনুযায়ী: Yong Yang, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-01-01)

Binding of κ-Conotoxin-PVIIA to Open and Closed Shaker K-Channels Are Differentially Affected by the Ionic Strength
অনুযায়ী: David Naranjo, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020-10-01)