Linkage disequilibrium and age of HLA region SNPs in relation to classic HLA gene alleles within Europe.

Linkage disequilibrium and age of HLA region SNPs in relation to classic HLA gene alleles within Europe.

The HLA region on chromosome 6 is gene-rich and under selective pressure because of the high proportion of immunity-related genes. Linkage disequilibrium (LD) patterns and allele frequencies in this region are highly differentiated across broad geographical populations, making it a region of interes...

תיאור מלא

מידע ביבליוגרפי
Main Authors:	Evseeva, I, Nicodemus, K, Bonilla, C, Tonks, S, Bodmer, W
פורמט:	Journal article
שפה:	English
יצא לאור:	2010

פריטים דומים

Analysis of linkage disequilibrium within the HLA region in 10 European populations
מאת: Evseeva, I, et al.
יצא לאור: (2008)

Has HLA diversity been influenced by seafaring in Northern Europe?
מאת: Evseeva, I, et al.
יצא לאור: (2006)

MICA diversity and linkage disequilibrium with HLA-B alleles in renal-transplant candidates in southern Brazil.
מאת: Roger Haruki Yamakawa, et al.
יצא לאור: (2017-01-01)

MHC Class I Chain-Related Gene A Polymorphisms and Linkage Disequilibrium with HLA-B and HLA-C Alleles in Ocular Toxoplasmosis.
מאת: Christiane Maria Ayo, et al.
יצא לאור: (2015-01-01)

A SNP approach to HLA typing analysis
מאת: Evseeva, I, et al.
יצא לאור: (2005)

Genetic variability and linkage disequilibrium within the HLA-DP region: analysis of 15 different populations.
מאת: Begovich, AB, et al.
יצא לאור: (2001)

HLA-A, -B, -Cw,-DQA1,-DQB1 and -DRB1 allele frequencies in a Nentsy population from Russia
מאת: Evseeva, I, et al.
יצא לאור: (2004)

HLA-A*7401-mediated control of HIV viremia is independent of its linkage disequilibrium with HLA-B*5703.
מאת: Matthews, P, et al.
יצא לאור: (2011)

Association of HLA-A and Non-Classical HLA Class I Alleles.
מאת: Federico Carlini, et al.
יצא לאור: (2016-01-01)

HLA-A, -B, -Cw, -DQA1 and -DRB1 allele frequencies in a population from Orkney, Scotland
מאת: Tonks, S, et al.
יצא לאור: (2004)

Prediction of HLA class II alleles using SNPs in an African population.
מאת: Fasil Tekola Ayele, et al.
יצא לאור: (2012-01-01)

Allele frequency matching between SNPs reveals an excess of linkage disequilibrium in genic regions of the human genome.
מאת: Michael A Eberle, et al.
יצא לאור: (2006-09-01)

HLA*IMP - an integrated framework for imputing classical HLA alleles from SNP genotypes
מאת: Dilthey, A, et al.
יצא לאור: (2011)

HLA*IMP--an integrated framework for imputing classical HLA alleles from SNP genotypes.
מאת: Dilthey, A, et al.
יצא לאור: (2011)

Genetic polymorphism of the human tumor necrosis factor region in insulin-dependent diabetes mellitus. Linkage disequilibrium of TNFab microsatellite alleles with HLA haplotypes.
מאת: Monos, D, et al.
יצא לאור: (1995)

Structural variants in linkage disequilibrium with GWAS-significant SNPs
מאת: Hao Liang, et al.
יצא לאור: (2024-06-01)

Performance of random forest when SNPs are in linkage disequilibrium
מאת: Cupples L Adrienne, et al.
יצא לאור: (2009-03-01)

Correction: Prediction of HLA Class II Alleles Using SNPs in an African Population
יצא לאור: (2012-01-01)

Correction: Prediction of HLA Class II Alleles Using SNPs in an African Population.
מאת: Fasil Tekola Ayele, et al.
יצא לאור: (2012-01-01)

HLA-A locus alleles identified by sequence specific PCR.
מאת: Krausa, P, et al.
יצא לאור: (1993)

World distribution of HLA alleles and implications for disease - Discussion
מאת: Kidd, K, et al.
יצא לאור: (1996)

HLA Class I and II profiles in São Miguel Island (Azores): genetic diversity and linkage disequilibrium
מאת: Cabral Rita, et al.
יצא לאור: (2010-05-01)

Empirical evaluations of analytical issues arising from predicting HLA alleles using multiple SNPs
מאת: Hansen John A, et al.
יצא לאור: (2011-04-01)

Linkage disequilibrium at PPARG and other genes assessed with dense sets of SNPs..
מאת: Hirschhorn, J, et al.
יצא לאור: (2001)

HLA-A, -B, -Cw, -DQA1,-DQB1 and -DRB1 allele frequencies in a Saami population from Russia
מאת: Evseeva, I, et al.
יצא לאור: (2004)

HLA-A, -B, -Cw,-DQA1,-DQB1 and -DRB1 allele frequencies in a Pomor population from Russia
מאת: Evseeva, I, et al.
יצא לאור: (2004)

Classical and Non-Classical HLA Alleles as Supplementary Markers in Indirect Kinship Parentage Testing
מאת: Diamanto Kouniaki, et al.
יצא לאור: (2022-08-01)

Association of HLA alleles with autism
מאת: Sayad A, et al.
יצא לאור: (2018-11-01)

A linkage disequilibrium-based approach to position unmapped SNPs in crop species
מאת: Seema Yadav, et al.
יצא לאור: (2021-10-01)

HLA AND DISEASE
מאת: Bodmer, W
יצא לאור: (1979)

A statistical method for predicting classical HLA alleles from SNP data.
מאת: Leslie, S, et al.
יצא לאור: (2008)

LD-Spline: Mapping SNPs on genotyping platforms to genomic regions using patterns of linkage disequilibrium
מאת: Bush William S, et al.
יצא לאור: (2009-12-01)

High Resolution Haplotype Analyses of Classical HLA Genes in Families With Multiple Sclerosis Highlights the Role of HLA-DP Alleles in Disease Susceptibility
מאת: Kazutoyo Osoegawa, et al.
יצא לאור: (2021-05-01)

A mutated HLA-A*0101 allele in the colorectal cell line HCA-7.
מאת: Bicknell, D, et al.
יצא לאור: (2005)

High resolution allele frequency analysis of HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1 and HLA-DPB1 in Guangdong Cord Blood Bank
מאת: RUI Derong, et al.
יצא לאור: (2024-11-01)

Characterization of the linkage disequilibrium structure and identification of tagging-SNPs in five DNA repair genes
מאת: Camp Nicola J, et al.
יצא לאור: (2005-08-01)

HLA Diversity in Saudi Population: High Frequency of Homozygous HLA Alleles and Haplotypes
מאת: Aziz Alami Chentoufi, et al.
יצא לאור: (2022-06-01)

Handling linkage disequilibrium in qualitative trait linkage analysis using dense SNPs: a two-step strategy
מאת: Dupuis Josée, et al.
יצא לאור: (2009-08-01)

Comparison of HLA allelic imputation programs.
מאת: Jason H Karnes, et al.
יצא לאור: (2017-01-01)

Evolution and function of the HLA system.
מאת: Bodmer, W, et al.
יצא לאור: (1978)