Translocating kilobase RNA through the Staphylococcal α-hemolysin nanopore.

Translocating kilobase RNA through the Staphylococcal α-hemolysin nanopore.

The electrophoretic translocation of polynucleotides through nanopores may permit direct single-molecule nucleic acid sequencing. Here we describe the translocation of ssRNA heteropolymers (91-6083 bases) through the α-hemolysin nanopore. Translocation of these long ssRNAs is characterized by surpri...

Detaylı Bibliyografya
Asıl Yazarlar:	Cracknell, J, Japrung, D, Bayley, H
Materyal Türü:	Journal article
Dil:	English
Baskı/Yayın Bilgisi:	2013

Benzer Materyaller

Urea facilitates the translocation of single-stranded DNA and RNA through the alpha-hemolysin nanopore.
Yazar:: Japrung, D, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

Redirecting pore assembly of staphylococcal α-hemolysin by protein engineering
Yazar:: Koo, S, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019)

Redirecting Pore Assembly of Staphylococcal α‑Hemolysin by Protein Engineering
Yazar:: Sunwoo Koo, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2019-03-01)

Enhanced translocation of single DNA molecules through alpha-hemolysin nanopores by manipulation of internal charge.
Yazar:: Maglia, G, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008)

Interactions between residues in staphylococcal alpha-hemolysin revealed by reversion mutagenesis.
Yazar:: Panchal, R, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1995)

Structure of staphylococcal alpha-hemolysin, a heptameric transmembrane pore.
Yazar:: Song, L, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1996)

Single pyrimidine discrimination during voltage-driven translocation of osmylated oligodeoxynucleotides via the α-hemolysin nanopore
Yazar:: Yun Ding, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016-01-01)

Subunit dimers of alpha-hemolysin expand the engineering toolbox for protein nanopores.
Yazar:: Hammerstein, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

Assembly of the oligomeric membrane pore formed by Staphylococcal alpha-hemolysin examined by truncation mutagenesis.
Yazar:: Walker, B, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1992)

Surface labeling of key residues during assembly of the transmembrane pore formed by staphylococcal alpha-hemolysin.
Yazar:: Krishnasastry, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1994)

Subunit stoichiometry of staphylococcal alpha-hemolysin in crystals and on membranes: a heptameric transmembrane pore.
Yazar:: Gouaux, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1994)

The internal cavity of the staphylococcal alpha-hemolysin pore accommodates approximately 175 exogenous amino acid residues.
Yazar:: Jung, Y, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2005)

Visualization of multivalent binding events using α-hemolysin
Yazar:: Gregoir, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020)

Imaging the assembly of the Staphylococcal pore-forming toxin alpha-Hemolysin
Yazar:: Thompson, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009)

Spontaneous oligomerization of a staphylococcal alpha-hemolysin conformationally constrained by removal of residues that form the transmembrane beta-barrel.
Yazar:: Cheley, S, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1997)

Capture and analysis of double‐stranded DNA with the α‐hemolysin nanopore: Fundamentals and applications
Yazar:: Shekemi Denuga, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-10-01)

Multistep protein unfolding during nanopore translocation.
Yazar:: Rodriguez-Larrea, D, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

Multistep protein unfolding during nanopore translocation
Yazar:: Rodriguez-Larrea, D, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013)

Key residues for membrane binding, oligomerization, and pore forming activity of staphylococcal alpha-hemolysin identified by cysteine scanning mutagenesis and targeted chemical modification.
Yazar:: Walker, B, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1995)

Molecular modeling reveals the novel inhibition mechanism and binding mode of three natural compounds to staphylococcal α-hemolysin.
Yazar:: Jiazhang Qiu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2013-01-01)

Analysis of single nucleic acid molecules with protein nanopores.
Yazar:: Maglia, G, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

Fluorinated amphiphiles control the insertion of α-hemolysin pores into lipid bilayers.
Yazar:: Raychaudhuri, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

RNase A does not translocate the alpha-hemolysin pore.
Yazar:: Besnik Krasniqi, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014-01-01)

Controlled translocation of individual DNA molecules through protein nanopores with engineered molecular brakes.
Yazar:: Rincon-Restrepo, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

Probabilistic Study on Subunit Mismatch Arrangement in Staphylococcal γ-hemolysin Heteroheptameric Transmembrane Pore
Yazar:: Noriko TOMITA, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011-10-01)

Biomedical diagnosis perspective of epigenetic detections using alpha-hemolysin nanopore
Yazar:: Yong Wang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2015-11-01)

DNA strands from denatured duplexes are translocated through engineered protein nanopores at alkaline pH.
Yazar:: Maglia, G, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009)

Bioproduction of pure, kilobase-scale single-stranded DNA
Yazar:: Shepherd, Tyson R, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021)

Detection of Tobacco Bacterial Wilt Caused by <i>Ralstonia solanacearum</i> by Combining Polymerase Chain Reaction with an α-Hemolysin Nanopore
Yazar:: Ying Wang, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-01-01)

Unfolding and refolding of monomeric and heptameric α-hemolysin
Yazar:: Henricus, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

Properties of Bacillus cereus hemolysin II: a heptameric transmembrane pore.
Yazar:: Miles, G, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2002)

Controlling DNA Translocation Through Solid-state Nanopores
Yazar:: Zhishan Yuan, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2020-04-01)

β-Hemolysin, not agrA mutation, inhibits the hemolysis of α-hemolysin in Staphylococcus aureus laboratory and clinical strains
Yazar:: Lin Liu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2024-02-01)

Nucleobase recognition in ssDNA at the central constriction of the alpha-hemolysin pore.
Yazar:: Stoddart, D, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

Membrane-Damaging Activity Against Various Phospholipid Liposomes by γ-hemolysin, Staphylococcal Two-Component Pore-Forming Cytolysin
Yazar:: Noriko TOMITA, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012-06-01)

A comprehensive microsatellite landscape of human Y-DNA at kilobase resolution
Yazar:: Douyue Li, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-01-01)

Logic Gate Operation by DNA Translocation through Biological Nanopores.
Yazar:: Hiroki Yasuga, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016-01-01)

Investigating the translocation of lambda-DNA molecules through PDMS nanopores
Yazar:: Karnik, Rohit, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

Deep functional analysis of synII, a 770-kilobase synthetic yeast chromosome.
Yazar:: Shen, Y, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2017)

Chromatin alternates between A and B compartments at kilobase scale for subgenic organization
Yazar:: Hannah L. Harris, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-06-01)