Genome-wide and fine-resolution association analysis of malaria in West Africa.

Genome-wide and fine-resolution association analysis of malaria in West Africa.

We report a genome-wide association (GWA) study of severe malaria in The Gambia. The initial GWA scan included 2,500 children genotyped on the Affymetrix 500K GeneChip, and a replication study included 3,400 children. We used this to examine the performance of GWA methods in Africa. We found conside...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Jallow, M, Teo, Y, Small, K, Rockett, K, Deloukas, P, Clark, T, Kivinen, K, Bojang, K, Conway, D, Pinder, M, Sirugo, G, Sisay-Joof, F, Usen, S, Auburn, S, Bumpstead, S, Campino, S, Coffey, A, Dunham, A, Fry, A, Green, A, Gwilliam, R, Hunt, SE, Inouye, M, Jeffreys, A, Mendy, A
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	2009

Схожі ресурси

A genetic association study in the Gambia using tagging polymorphisms in the major histocompatibility complex class III region implicates a HLA-B associated transcript 2 polymorphism in severe malaria susceptibility.
за авторством: Diakite, M, та інші
Опубліковано: (2009)

Allelic heterogeneity of G6PD deficiency in West Africa and severe malaria susceptibility
за авторством: Clark, T, та інші
Опубліковано: (2009)

Allelic heterogeneity of G6PD deficiency in West Africa and severe malaria susceptibility.
за авторством: Clark, T, та інші
Опубліковано: (2009)

Further evidence supporting a role for gs signal transduction in severe malaria pathogenesis
за авторством: Auburn, S, та інші
Опубліковано: (2010)

TLR9 polymorphisms in African populations: no association with severe malaria, but evidence of cis-variants acting on gene expression
за авторством: Campino, S, та інші
Опубліковано: (2009)

Tumor necrosis factor and lymphotoxin-alpha polymorphisms and severe malaria in African populations.
за авторством: Clark, T, та інші
Опубліковано: (2009)

A comparison of case-control and family-based association methods: the example of sickle-cell and malaria.
за авторством: Ackerman, H, та інші
Опубліковано: (2005)

Investigation of malaria susceptibility determinants in the IFNG/IL26/IL22 genomic region.
за авторством: Koch, O, та інші
Опубліковано: (2005)

Clinical features of severe malaria associated with death: a 13-year observational study in the Gambia
за авторством: Jallow, M, та інші
Опубліковано: (2012)

Association of the GNAS locus with severe malaria.
за авторством: Auburn, S, та інші
Опубліковано: (2008)

Positive selection of a CD36 nonsense variant in sub-Saharan Africa, but no association with severe malaria phenotypes
за авторством: Fry, A, та інші
Опубліковано: (2009)

Variation in the ICAM1 gene is not associated with severe malaria phenotypes.
за авторством: Fry, A, та інші
Опубліковано: (2008)

Lack of association of interferon regulatory factor 1 with severe malaria in affected child-parental trio studies across three African populations
за авторством: Mangano, V, та інші
Опубліковано: (2009)

Nucleotide and haplotypic diversity of the NOS2A promoter region and its relationship to cerebral malaria (vol 112, pg 379, 2003)
за авторством: Burgner, D, та інші
Опубліковано: (2004)

Nucleotide and haplotypic diversity of the NOS2A promoter region and its relationship to cerebral malaria.
за авторством: Burgner, D, та інші
Опубліковано: (2003)

Common variation in the ABO glycosyltransferase is associated with susceptibility to severe Plasmodium falciparum malaria.
за авторством: Fry, A, та інші
Опубліковано: (2008)

A hallmark of balancing selection is present at the promoter region of interleukin 10.
за авторством: Wilson, J, та інші
Опубліковано: (2006)

Analysis of IL10 haplotypic associations with severe malaria.
за авторством: Wilson, J, та інші
Опубліковано: (2005)

Imputation-based meta-analysis of severe malaria in three African populations
за авторством: Band, G, та інші
Опубліковано: (2013)

Clinical features of severe malaria associated with death: a 13-year observational study in the Gambia.
за авторством: Muminatou Jallow, та інші
Опубліковано: (2012-01-01)

Further evidence supporting a role for gs signal transduction in severe malaria pathogenesis.
за авторством: Sarah Auburn, та інші
Опубліковано: (2010-04-01)

Whole genome-amplified DNA: insights and imputation.
за авторством: Teo, Y, та інші
Опубліковано: (2008)

<it>TLR9 </it>polymorphisms in African populations: no association with severe malaria, but evidence of <it>cis</it>-variants acting on gene expression
за авторством: Pinder Margaret, та інші
Опубліковано: (2009-03-01)

Implications of inter-population linkage disequilibrium patterns on the approach to a disease association study in the human MHC class III.
за авторством: Hanchard, N, та інші
Опубліковано: (2006)

Nucleotide diversity of the TNF gene region in an African village.
за авторством: Richardson, A, та інші
Опубліковано: (2001)

A genotype calling algorithm for the Illumina BeadArray platform.
за авторством: Teo, Y, та інші
Опубліковано: (2007)

A genotype calling algorithm for the Illumina BeadArray platform.
за авторством: Teo, Y, та інші
Опубліковано: (2007)

A Bayesian approach using covariance of single nucleotide polymorphism data to detect differences in linkage disequilibrium patterns between groups of individuals.
за авторством: Clark, T, та інші
Опубліковано: (2010)

A Bayesian approach using covariance of single nucleotide polymorphism data to detect differences in linkage disequilibrium patterns between groups of individuals.
за авторством: Clark, T, та інші
Опубліковано: (2010)

Haplotypic relationship between SNP and microsatellite markers at the NOS2A locus in two populations.
за авторством: Burgner, D, та інші
Опубліковано: (2003)

Population-specific patterns of linkage disequilibrium in the human 5q31 region
за авторством: Luoni, G, та інші
Опубліковано: (2005)

Validating discovered Cis-acting regulatory genetic variants: application of an allele specific expression approach to HapMap populations
за авторством: Campino, S, та інші
Опубліковано: (2008)

Prevention of the recurrence of anaemia in Gambian children following discharge from hospital.
за авторством: Kalifa A Bojang, та інші
Опубліковано: (2010-06-01)

Haplotypic analysis of the TNF locus by association efficiency and entropy
за авторством: Ackerman, H, та інші
Опубліковано: (2003)

Haplotypic analysis of the TNF locus by association efficiency and entropy.
за авторством: Ackerman, H, та інші
Опубліковано: (2003)

Population-specific patterns of linkage disequilibrium in the human 5q31 region.
за авторством: Luoni, G, та інші
Опубліковано: (2005)

Erratum: Nucleotide and haplotypic diversity of the NOS2A promoter region and its relationship to cerebral malaria (Human Genetics (2003) vol. 112 (379-386))
за авторством: Burgner, D, та інші
Опубліковано: (2004)

Malaria protection due to sickle haemoglobin depends on parasite genotype
за авторством: Band, G, та інші
Опубліковано: (2021)

IFNGR1 gene promoter polymorphisms and susceptibility to cerebral malaria.
за авторством: Koch, O, та інші
Опубліковано: (2002)

Complex haplotypic structure of the central MHC region flanking TNF in a West African population.
за авторством: Ackerman, H, та інші
Опубліковано: (2003)