The interplay of supercoiling and thymine dimers in DNA

The interplay of supercoiling and thymine dimers in DNA

Thymine dimers are a major mutagenic photoproduct induced by UV radiation. While they have been the subject of extensive theoretical and experimental investigations, questions of how DNA supercoiling affects local defect properties, or, conversely, how the presence of such defects changes global sup...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Lim, W, Randisi, F, Doye, JPK, Louis, AA
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	Oxford University Press 2022

Những quyển sách tương tự

Coarse-grained modelling of supercoiled RNA
Bằng: Matek, C, et al.
Được phát hành: (2015)

Plectoneme tip bubbles : coupled denaturation and writhing in supercoiled DNA
Bằng: Matek, C, et al.
Được phát hành: (2015)

How Does Thymine DNA Survive Ultrafast Dimerization Damage?
Bằng: Hongjuan Wang, et al.
Được phát hành: (2016-12-01)

Structural interplay between DNA-shape protein recognition and supercoiling: The case of IHF
Bằng: George D. Watson, et al.
Được phát hành: (2022-01-01)

Supercoils in human DNA.
Bằng: Cook, P, et al.
Được phát hành: (1975)

Measuring internal forces in single-stranded DNA: application to a DNA force clamp
Bằng: Engel, MC, et al.
Được phát hành: (2020)

DNA sequence encodes the position of DNA supercoils
Bằng: Sung Hyun Kim, et al.
Được phát hành: (2018-12-01)

A Compass at Weak Magnetic Fields Using Thymine Dimer Repair
Bằng: Theodore J. Zwang, et al.
Được phát hành: (2018-03-01)

Theory and simulation of DNA damage and supercoiling
Bằng: Selby, M
Được phát hành: (2023)

The study of G-quadruplex in supercoiled DNA
Bằng: Lv, Bei
Được phát hành: (2016)

Role of Supercoiling and Topoisomerases in DNA Knotting
Bằng: Jorge Cebrián, et al.
Được phát hành: (2024-05-01)

Control of bacterrial DNA supercoiling : microreview /
Bằng: 397617 Drlica, Karl

Force-induced rupture of a DNA duplex: from fundamentals to force sensors
Bằng: Mosayebi, M, et al.
Được phát hành: (2015)

Reply to Ocklenburg and Mundorf: the interplay of developmental bias and natural selection
Bằng: Johnston, IG, et al.
Được phát hành: (2022)

Novel Expression of Thymine Dimers in Renal Cell Carcinoma, Demonstrated through Immunohistochemistry
Bằng: Dorin Novacescu, et al.
Được phát hành: (2022-10-01)

The effect of supercoiling on small molecule-DNA interactions
Bằng: LaMarr, William Albino, 1969-
Được phát hành: (2010)

SUPERCOILS IN NUCLEAR-DNA AND REPAIR OF RADIATION-DAMAGE
Bằng: Cook, P, et al.
Được phát hành: (1977)

Coarse-grained modelling of DNA-RNA hybrids
Bằng: Ratajczyk, EJ, et al.
Được phát hành: (2023)

Counterintuitive DNA Sequence Dependence in Supercoiling-Induced DNA Melting.
Bằng: Rifka Vlijm, et al.
Được phát hành: (2015-01-01)

Supercoiling of DNA and nuclear conformation during the cell-cycle.
Bằng: Warren, A, et al.
Được phát hành: (1978)

HU of Streptococcus pneumoniae Is Essential for the Preservation of DNA Supercoiling
Bằng: María-José Ferrándiz, et al.
Được phát hành: (2018-03-01)

Analysis of the structural changes caused by positive DNA supercoiling
Bằng: Barth, Marita Christine
Được phát hành: (2008)

The free-energy landscape of a mechanically bistable DNA origami
Bằng: Wong, CK, et al.
Được phát hành: (2022)

Kinetic Study of DNA Topoisomerases by Supercoiling-Dependent Fluorescence Quenching
Bằng: Yunke Wang, et al.
Được phát hành: (2019-10-01)

Direct simulation of the self-assembly of a small DNA origami
Bằng: Snodin, BEK, et al.
Được phát hành: (2016)

Differential Effects of Biomimetic Thymine Dimers and Corresponding Photo-Adducts in Primary Human Keratinocytes and Fibroblasts
Bằng: Rosanna Monetta, et al.
Được phát hành: (2024-11-01)

Flavonols Protect Against UV Radiation-Induced Thymine Dimer Formation in an Artificial Skin Mimic
Bằng: Sabia Maini, et al.
Được phát hành: (2015-10-01)

mwr Xer site-specific recombination is hypersensitive to DNA supercoiling
Bằng: Trigueros, S, et al.
Được phát hành: (2009)

Oncofetal HMGA2 effectively curbs unconstrained (+) and (−) DNA supercoiling
Bằng: Zhao, Xiaodan, et al.
Được phát hành: (2018)

mwr Xer site-specific recombination is hypersensitive to DNA supercoiling.
Bằng: Trigueros, S, et al.
Được phát hành: (2009)

Evaluation of novel chromatographic prototypes for supercoiled plasmid DNA polishing
Bằng: Pedro L. Ferreira, et al.
Được phát hành: (2024-01-01)

DNA Supercoiling: an Ancestral Regulator of Gene Expression in Pathogenic Bacteria?
Bằng: Shiny Martis B., et al.
Được phát hành: (2019-01-01)

DNA supercoiling and transcription in bacteria: a two-way street
Bằng: Charles J. Dorman
Được phát hành: (2019-07-01)

Supercoiling Effects on Short-Range DNA Looping in E. coli.
Bằng: Lauren S Mogil, et al.
Được phát hành: (2016-01-01)

Rates of gyrase supercoiling and transcription elongation control supercoil density in a bacterial chromosome.
Bằng: Nikolay Rovinskiy, et al.
Được phát hành: (2012-01-01)

Electrophoretic Mobility Assay to Separate Supercoiled, Catenated, and Knotted DNA Molecules
Bằng: Jorge Cebrián, et al.
Được phát hành: (2024-05-01)

DNA supercoiling differences in bacteria result from disparate DNA gyrase activation by polyamines.
Bằng: Alexandre Duprey, et al.
Được phát hành: (2020-10-01)

Base excision by thymine DNA glycosylase mediates DNA-directed cytotoxicity of 5-fluorouracil.
Bằng: Christophe Kunz, et al.
Được phát hành: (2009-04-01)

Asymmetric removal of supercoils suggests how topoisomerase II simplifies DNA topology.
Bằng: Trigueros, S, et al.
Được phát hành: (2004)

Chromatin architectural factors as safeguards against excessive supercoiling during DNA replication
Bằng: Ahmed, Syed Moiz, et al.
Được phát hành: (2021)