A multi-scale method for the calculation of charge transfer rates through the Pi-stack of DNA: application to DNA dynamics.

A multi-scale method for the calculation of charge transfer rates through the Pi-stack of DNA: application to DNA dynamics.

We describe an ultra-fast, multi-scale method for calculating charge transfer rates through the pi-stack of DNA using a simple charge hopping model in conjunction with the Marcus equation. The calculation of the parameters required as input to the Marcus equation, such as the electronic coupling and...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Reha, D, Barford, W, Harris, S
Формат:	Journal article
Мова:	English
Опубліковано:	2008

Схожі ресурси

Stacking Effects on Anthraquinone/DNA Charge-Transfer Electronically Excited States
за авторством: Gustavo Cárdenas, та інші
Опубліковано: (2020-12-01)

Programing the formation of DNA and PNA quadruplexes by pi-pi-stacking interactions.
за авторством: Saha, S, та інші
Опубліковано: (2010)

Controllable charge transfer via DNA molecules
за авторством: Liu, Yuanjun
Опубліковано: (2015)

Charge transfer in DNA : from mechanism to application /
за авторством: Wagenknecht, Hans-Achim
Опубліковано: (2005)

Energy Transfer in Single-Stranded DNA-Templated Stacks of Naphthalene Chromophores
за авторством: Stevens, A, та інші
Опубліковано: (2011)

DNA-Mediated Stack Formation of Nanodiscs
за авторством: Madhumalar Subramanian, та інші
Опубліковано: (2021-03-01)

Enhanced H-bonding and pi-stacking in DNA: a potent duplex-stabilizing and mismatch sensing nucleobase analogue
за авторством: Lou, C, та інші
Опубліковано: (2014)

Realistic model of charge mobility in pi-conjugated polymer systems
за авторством: Berencei, L, та інші
Опубліковано: (2019)

The role of loop stacking in the dynamics of DNA hairpin formation.
за авторством: Mosayebi, M, та інші
Опубліковано: (2014)

Electronic Circular Dichroism Spectra of DNA Quadruple Helices Studied by Molecular Dynamics Simulations and Excitonic Calculations including Charge Transfer States
за авторством: Haritha Asha, та інші
Опубліковано: (2021-08-01)

Pi-Pi STACKING OF THE AROMATIC GROUPS IN LIGNOSULFONATES
за авторством: Yonghong Deng,, та інші
Опубліковано: (2012-01-01)

Match probability calculations for multi-locus DNA profiles.
за авторством: Donnelly, P
Опубліковано: (1995)

Quantum Well Model for Charge Transfer in Aperiodic DNA and Superlattice Sequences
за авторством: Alan Tai
Опубліковано: (2024-08-01)

Symmetry Breaking Charge Transfer in DNA-Templated Perylene Dimer Aggregates
за авторством: Katelyn M. Duncan, та інші
Опубліковано: (2022-10-01)

Mixed algorithm for modeling of charge transfer in DNA on long time intervals
за авторством: Nadejda S. Fialko
Опубліковано: (2010-03-01)

StackDPP: a stacking ensemble based DNA-binding protein prediction model
за авторством: Sheikh Hasib Ahmed, та інші
Опубліковано: (2024-03-01)

Insights into the control of optoelectronic properties in mixed-stacking charge-transfer complexes
за авторством: Wang, Zongrui, та інші
Опубліковано: (2021)

A model for sample stacking in microcapillary DNA electrophoresis
за авторством: Srivastava, Alok Kumar, 1967-
Опубліковано: (2006)

Unraveling the charge transfer variation of tetrathiafulvalene-based organic crystals through fragment charge difference calculation
за авторством: Yakui Mu, та інші
Опубліковано: (2023-03-01)

The 2Ih and <sup>OXO</sup>G Proximity Consequences on Charge Transfer through <i>ds</i>-DNA: Theoretical Studies of Clustered DNA Damage
за авторством: Boleslaw T. Karwowski
Опубліковано: (2023-02-01)

An accurate and linear-scaling method for calculating charge-transfer excitation energies and diabatic couplings
за авторством: Pavanello, Michele, та інші
Опубліковано: (2013)

A Variational Estimate of the Binding Energy of Charge-Transfer Excitons in the Cuprate Superconductors.
за авторством: Vermeulen, C, та інші
Опубліковано: (1995)

The Dynamics of Hole Transfer in DNA
за авторством: Andrea Peluso, та інші
Опубліковано: (2019-11-01)

Synthesis, spectroscopic characterization, DNA binding and DFT/PCM calculations of new Hydrogen-bonded charge transfer complex between 4-dimethylaminopyridine and Chloranilic acid
за авторством: Vudutha Sundarpal, та інші
Опубліковано: (2023-01-01)

Activating charge-transfer state formation in strongly-coupled dimers using DNA scaffolds
за авторством: Hart, Stephanie M, та інші
Опубліковано: (2023)

The AT Interstrand Cross-Link: Structure, Electronic Properties, and Influence on Charge Transfer in dsDNA
за авторством: Boleslaw T. Karwowski
Опубліковано: (2018-12-01)

Model for Rating a Vanadium Redox Flow Battery Stack through Constant Power Charge–Discharge Characterization
за авторством: Pavan Kumar Vudisi, та інші
Опубліковано: (2022-08-01)

Approaches to formation and calculation of airport charges’ rates
за авторством: V. A. Gubenk, та інші
Опубліковано: (2017-08-01)

Short-Range Charge Transfer in DNA Base Triplets: Real-Time Tracking of Coherent Fluctuation Electron Transfer
за авторством: Lixia Zhu, та інші
Опубліковано: (2023-09-01)

The wireless DNA transfer /
за авторством: Kumara Velu, 1961-
Опубліковано: (c201)

Low bias charge transport in DNA
за авторством: Maciej Wiesner, та інші
Опубліковано: (2024-09-01)

Unraveling the Effect of Stacking Configurations on Charge Transfer in WS2 and Organic Semiconductor Heterojunctions
за авторством: Shuchen Zhang, та інші
Опубліковано: (2023-06-01)

Charge Transfer Excitons and Possible Exitonic Pairing in the Extended Three Band Hubbard Model
за авторством: Vermeulen, C, та інші
Опубліковано: (1995)

Robustness of DNA repair through collective rate control.
за авторством: Paul Verbruggen, та інші
Опубліковано: (2014-01-01)

Activation of DNA Transposons and Evolution of piRNA Genes Through Interspecific Hybridization in Xenopus Frogs
за авторством: Kosuke Suda, та інші
Опубліковано: (2022-01-01)

6mA-StackingCV: an improved stacking ensemble model for predicting DNA N6-methyladenine site
за авторством: Guohua Huang, та інші
Опубліковано: (2023-11-01)

Origin of the intermolecular forces that produce donor–acceptor stacks in π-conjugated charge-transfer complexes
за авторством: Seiji Tsuzuki, та інші
Опубліковано: (2024-11-01)

Rate constant calculations on the N(S-4)+OH((2)Pi) reaction
за авторством: Edvardsson, D, та інші
Опубліковано: (2006)

Charge transfer through single molecule contacts: How reliable are rate descriptions?
за авторством: Denis Kast, та інші
Опубліковано: (2011-08-01)

Electric Field of DNA in Solution: Who Is in Charge?
за авторством: Jonathan G. Hedley, та інші
Опубліковано: (2024-09-01)