Programmable energy landscapes for kinetic control of DNA strand displacement.

Programmable energy landscapes for kinetic control of DNA strand displacement.

DNA is used to construct synthetic systems that sense, actuate, move and compute. The operation of many dynamic DNA devices depends on toehold-mediated strand displacement, by which one DNA strand displaces another from a duplex. Kinetic control of strand displacement is particularly important in au...

Volledige beschrijving

Bibliografische gegevens
Hoofdauteurs:	Machinek, R, Ouldridge, T, Haley, N, Bath, J, Turberfield, A
Formaat:	Journal article
Taal:	English
Gepubliceerd in:	Nature Publishing Group 2014

Gelijkaardige items

Design of hidden thermodynamic driving for non-equilibrium systems via mismatch elimination during DNA strand displacement
door: Haley, NEC, et al.
Gepubliceerd in: (2020)

On the biophysics and kinetics of toehold-mediated DNA strand displacement
door: Srinivas, N, et al.
Gepubliceerd in: (2013)

Combinatorial displacement of DNA strands: application to matrix multiplication and weighted sums.
door: Genot, A, et al.
Gepubliceerd in: (2013)

A cascade of DNA strand displacements using toehold-mediated exchange
door: Lally, P, et al.
Gepubliceerd in: (2010)

Design of hidden thermodynamic driving for non-equilibrium systems via mismatch elimination during DNA strand displacement
door: Natalie E. C. Haley, et al.
Gepubliceerd in: (2020-05-01)

DNA hybridization kinetics: zippering, internal displacement and sequence dependence.
door: Ouldridge, T, et al.
Gepubliceerd in: (2013)

Modelling toehold-mediated RNA strand displacement
door: Šulc, P, et al.
Gepubliceerd in: (2015)

Optimizing DNA nanotechnology through coarse-grained modeling: a two-footed DNA walker.
door: Ouldridge, T, et al.
Gepubliceerd in: (2013)

Remote toehold: A mechanism for flexible control of DNA hybridization kinetics
door: Genot, A, et al.
Gepubliceerd in: (2011)

Remote toehold: a mechanism for flexible control of DNA hybridization kinetics.
door: Genot, A, et al.
Gepubliceerd in: (2011)

Guiding the folding pathway of DNA origami.
door: Dunn, K, et al.
Gepubliceerd in: (2015)

Modelling DNA origami self-assembly at the domain level.
door: Dannenberg, F, et al.
Gepubliceerd in: (2015)

Control and observation of DNA nanodevices
door: Machinek, R, et al.
Gepubliceerd in: (2014)

Guiding the folding pathway of DNA origami
door: Dunn, KE, et al.
Gepubliceerd in: (2015)

Two-Domain DNA Strand Displacement
door: Luca Cardelli
Gepubliceerd in: (2010-06-01)

Modelling DNA origami self-assembly at the domain level
door: Dannenberg, F, et al.
Gepubliceerd in: (2015)

A DNA molecular printer capable of programmable positioning and patterning in two dimensions
door: Benson, E, et al.
Gepubliceerd in: (2022)

Modular DNA strand-displacement controllers for directing material expansion
door: Joshua Fern, et al.
Gepubliceerd in: (2018-09-01)

An Operational DNA Strand Displacement Encryption Approach
door: Enqiang Zhu, et al.
Gepubliceerd in: (2022-03-01)

Logical Reasoning Based on DNA Strand Displacement
door: WU Li-bo, HUANG Yu-fang
Gepubliceerd in: (2022-01-01)

A programmable molecular robot.
door: Muscat, R, et al.
Gepubliceerd in: (2011)

DNA nanomachines.
door: Bath, J, et al.
Gepubliceerd in: (2007)

DNA strand displacement based computational systems and their applications
door: Congzhou Chen, et al.
Gepubliceerd in: (2023-02-01)

Double Synchronization Based on DNA Strand Displacement Reaction
door: Junwei Sun, et al.
Gepubliceerd in: (2020-01-01)

Four-Analog Computation Based on DNA Strand Displacement
door: Chengye Zou, et al.
Gepubliceerd in: (2017-08-01)

Molecular Full Adder Based on DNA Strand Displacement
door: Wei Xiao, et al.
Gepubliceerd in: (2020-01-01)

Kinetically controlled self-assembly of DNA oligomers.
door: Lubrich, D, et al.
Gepubliceerd in: (2009)

Programmable one-pot multistep organic synthesis using DNA junctions.
door: McKee, M, et al.
Gepubliceerd in: (2012)

Sequential super-resolution imaging using DNA strand displacement.
door: Sandeep Pallikkuth, et al.
Gepubliceerd in: (2018-01-01)

The effect of topology on the structure and free energy landscape of DNA kissing complexes.
door: Romano, F, et al.
Gepubliceerd in: (2012)

In vivo occupancy of mitochondrial single-stranded DNA binding protein supports the strand displacement mode of DNA replication.
door: Javier Miralles Fusté, et al.
Gepubliceerd in: (2014-12-01)

Molecular machinery built from DNA
door: Bath, J, et al.
Gepubliceerd in: (2013)

DNA Logic Multiplexing Using Toehold-Mediated Strand Displacement
door: Congzhou Chen, et al.
Gepubliceerd in: (2020-01-01)

A novel bio-sensor based on DNA strand displacement.
door: Xiaolong Shi, et al.
Gepubliceerd in: (2014-01-01)

DNA dynamics and computation based on toehold-free strand displacement
door: Hong Kang, et al.
Gepubliceerd in: (2021-08-01)

Catalytic DNA Strand Displacement Cascades Applied to Logic Programming
door: Nelson E. Ordonez-Guillen, et al.
Gepubliceerd in: (2019-01-01)

DNA logic gate based on metallo-toehold strand displacement.
door: Wei Deng, et al.
Gepubliceerd in: (2014-01-01)

DNA Nanotechnology in the Undergraduate Laboratory: Toehold-Less Strand Displacement in Switchback DNA
door: Bharath Raj Madhanagopal, et al.
Gepubliceerd in: (2025-01-01)

Quantitative Analysis of the Effect of Fluorescent Labels on DNA Strand Displacement Reaction
door: Masato Toyonari, et al.
Gepubliceerd in: (2024-11-01)

Matrix-Chain Multiplication Based on Combinatorial Allosteric DNA Strand Displacement
door: Hengyan Guo, et al.
Gepubliceerd in: (2024-01-01)