Integrating genealogical and dynamical modelling to infer escape and reversion rates in HIV epitopes.

Integrating genealogical and dynamical modelling to infer escape and reversion rates in HIV epitopes.

Hiển thị phiên bản (1) khác

The rates of escape and reversion in response to selection pressure arising from the host immune system, notably the cytotoxic T-lymphocyte (CTL) response, are key factors determining the evolution of HIV. Existing methods for estimating these parameters from cross-sectional population data using or...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính:	Palmer, D, Frater, J, Phillips, R, McLean, A, McVean, G
Định dạng:	Journal article
Ngôn ngữ:	English
Được phát hành:	2013

Những quyển sách tương tự

Integrating genealogical and dynamical modelling to infer escape and reversion rates in HIV epitopes.
Bằng: Palmer, D, et al.
Được phát hành: (2013)

A genealogical interpretation of principal components analysis.
Bằng: McVean, G
Được phát hành: (2009)

Germs, genomes and genealogies.
Bằng: Wilson, D, et al.
Được phát hành: (2005)

Efficient coalescent simulation and genealogical analysis for large sample sizes
Bằng: Kelleher, J, et al.
Được phát hành: (2015)

Efficient Coalescent Simulation and Genealogical Analysis for Large Sample Sizes.
Bằng: Jerome Kelleher, et al.
Được phát hành: (2016-05-01)

Modelling the evolution and spread of HIV immune escape mutants.
Bằng: Helen R Fryer, et al.
Được phát hành: (2010-11-01)

A unified genealogy of modern and ancient genomes
Bằng: Wohns, AW, et al.
Được phát hành: (2022)

CYTOTOXIC T-LYMPHOCYTE RECOGNITION OF HIV - EPITOPE SELECTION AND ESCAPE
Bằng: Mcmichael, A, et al.
Được phát hành: (1993)

Modelling the evolution and spread of HIV immune escape mutants.
Bằng: Fryer, H, et al.
Được phát hành: (2010)

Structured observations reveal slow HIV-1 CTL escape
Bằng: Roberts, H, et al.
Được phát hành: (2015)

Cytotoxic T-lymphocyte escape mutations identified by HLA association favor those which escape and revert rapidly.
Bằng: Fryer, H, et al.
Được phát hành: (2012)

Modelling the spread of HIV immune escape mutants in a vaccinated population
Bằng: Fryer, H, et al.
Được phát hành: (2011)

Longitudinal analysis of an HLA-B*51-restricted epitope in integrase reveals immune escape in early HIV-1 infection.
Bằng: Yager, N, et al.
Được phát hành: (2013)

CTL epitope escape and reversion in acute HCV infection.
Bằng: Timm, J, et al.
Được phát hành: (2004)

HLA-associated clinical progression correlates with epitope reversion rates in early human immunodeficiency virus infection.
Bằng: Duda, A, et al.
Được phát hành: (2009)

Modelling the spread of HIV immune escape mutants in a vaccinated population.
Bằng: Helen R Fryer, et al.
Được phát hành: (2011-12-01)

Structured observations reveal slow HIV-1 CTL escape.
Bằng: Hannah E Roberts, et al.
Được phát hành: (2015-02-01)

CD8 epitope escape and reversion in acute HCV infection.
Bằng: Timm, J, et al.
Được phát hành: (2004)

Inferring HIV escape rates from multi-locus genotype data
Bằng: Taylor A Kessinger, et al.
Được phát hành: (2013-09-01)

Recombination rate estimation in the presence of hotspots.
Bằng: Auton, A, et al.
Được phát hành: (2007)

Estimating recombination rates from genetic variation in humans.
Bằng: Auton, A, et al.
Được phát hành: (2012)

Estimating recombination rates from population-genetic data.
Bằng: Stumpf, M, et al.
Được phát hành: (2003)

A genealogical interpretation of linkage disequilibrium.
Bằng: Mcvean, G
Được phát hành: (2002)

Quantifying factors determining the rate of CTL escape and reversion during acute and chronic phases of HIV infection
Bằng: Ganusov, V, et al.
Được phát hành: (2010)

Estimating meiotic gene conversion rates from population genetic data.
Bằng: Gay, J, et al.
Được phát hành: (2007)

Vertical T cell immunodominance and epitope entropy determine HIV-1 escape.
Bằng: Liu, M, et al.
Được phát hành: (2013)

CTL escape mediated by proteasomal destruction of an HIV-1 cryptic epitope.
Bằng: Sylvain Cardinaud, et al.
Được phát hành: (2011-05-01)

Mapping the drivers of within-host pathogen evolution using massive data sets
Bằng: Palmer, D, et al.
Được phát hành: (2019)

(Critical) Reverse Engineering and Genealogy
Bằng: Robert W. Gehl
Được phát hành: (2017-04-01)

A natural encoding of genetic variation in a Burrows-Wheeler Transform to enable mapping and genome inference
Bằng: Iqbal, Z, et al.
Được phát hành: (2016)

A natural encoding of genetic variation in a Burrows-Wheeler Transform to enable mapping and genome inference
Bằng: Iqbal, Z, et al.
Được phát hành: (2016)

HIV escapes from cytoxic lymphocytes
Bằng: McMichael, A, et al.
Được phát hành: (1996)

Inferring whole-genome histories in large population datasets
Bằng: Kelleher, J, et al.
Được phát hành: (2019)

OA06-03. Dynamics of CTL epitope escape and reversion in an African subtype C cohort
Bằng: Allen S, et al.
Được phát hành: (2009-10-01)

The structure of linkage disequilibrium around a selective sweep.
Bằng: McVean, G
Được phát hành: (2007)

Evolutionary genetics: what is driving male mutation?
Bằng: McVean, G
Được phát hành: (2000)

What drives recombination hotspots to repeat DNA in humans?
Bằng: McVean, G
Được phát hành: (2010)

Linkage Disequilibrium, Recombination and Selection
Bằng: McVean, G
Được phát hành: (2008)

Epitope length variants balance protective immune responses and viral escape in HIV-1 infection
Bằng: Pymm, P, et al.
Được phát hành: (2022)

Mother-to-child transmission of HIV infection and CTL escape through HLA-A2-SLYNTVATL epitope sequence variation.
Bằng: Goulder, P, et al.
Được phát hành: (2001)