Continuum vs. particle simulations of model nano-pores

Continuum vs. particle simulations of model nano-pores

The class of biological macromolecules known as ion channels are becoming of great interest to physical scientists and engineers, as well as biophysicists and pharmacologists. The long term stability and wide range of properties displayed by this large group of proteins makes them one of the most po...

Detaylı Bibliyografya
Asıl Yazarlar:	Millar, C, Roy, S, Beckstein, O, Sansom, M, Asenov, A
Materyal Türü:	Journal article
Dil:	English
Baskı/Yayın Bilgisi:	2007

Benzer Materyaller

Brownian simulation of charge transport in alpha-Haemolysin
Yazar:: Millar, C, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008)

Brownian simulation of charge transport in α-Haemolysin
Yazar:: Millar, C, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2008)

Water in transmembrane pores: Simulation studies.
Yazar:: Sansom, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2001)

The influence of geometry, surface character, and flexibility on the permeation of ions and water through biological pores.
Yazar:: Beckstein, O, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2004)

Water in ion channels and pores--simulation studies.
Yazar:: Sansom, MS, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2002)

OmpA: a pore or not a pore? Simulation and modeling studies.
Yazar:: Bond, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2002)

Biomimetic design of a brush-like nanopore: simulation studies.
Yazar:: Pongprayoon, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Equivalent Circuit and Continuum Modeling of the Impedance of Electrolyte-Filled Pores
Yazar:: Christian Pedersen, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-10-01)

Preparation of Nano Pore ZSM-5 Membranes: Experimental, Modeling and Simulation
Yazar:: Mansoor Kazemimoghadam, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2018-01-01)

Lipidbook: A Public Repository for Force-Field Parameters Used in Membrane Simulations
Yazar:: Domański, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

The pore domain of the nicotinic acetylcholine receptor: molecular modeling, pore dimensions, and electrostatics
Yazar:: Sankararamakrishnan, R, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1996)

Simulations of anion transport through OprP reveal the molecular basis for high affinity and selectivity for phosphate.
Yazar:: Pongprayoon, P, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2009)

Improved Volume-Of-Solid Formulations for Micro-Continuum Simulation of Mineral Dissolution at the Pore-Scale
Yazar:: Julien Maes, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-07-01)

Transbilayer pores formed by β-barrels: molecular modeling of pore structures and properties
Yazar:: Sansom, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1995)

Conformational Space and Dynamics of Sodium-Coupled Symporters
Yazar:: Beckstein, O, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2011)

The closed gate of the nicotinic receptor, identified by molecular dynamics free energy calculations
Yazar:: Beckstein, O, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2005)

The importance of surface character, geometry and flexibility in a hydrophobic gating mechanism for ion channels
Yazar:: Beckstein, O, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2004)

Lipidbook: a public repository for force-field parameters used in membrane simulations.
Yazar:: Domański, J, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2010)

Simulations of a protein translocation pore: SecY.
Yazar:: Haider, S, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2006)

Continuum modeling of particle suspension conductivity
Yazar:: Olsen, Tyler J. (Tyler John)
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

A hydrophobic gate in an ion channel: the closed state of the nicotinic acetylcholine receptor.
Yazar:: Beckstein, O, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2006)

Liquid-vapor oscillations of water in hydrophobic nanopores.
Yazar:: Beckstein, O, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2003)

Coarse-grain simulations reveal movement of the synaptobrevin C-terminus in response to piconewton forces.
Yazar:: Lindau, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Simulation experiment and mathematical model analysis for shale gas diffusion in nano-scale pores
Yazar:: Yu ZOU, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-09-01)

Fluid‐Driven Transport of Round Sediment Particles: From Discrete Simulations to Continuum Modeling
Yazar:: Zhang, Qiong, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022)

Simulation of diffusiophoresis force and the confinement effect of Janus particles with the continuum method
Yazar:: Meiling Wu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014-03-01)

Continuum modeling of dislocation starvation and subsequent nucleation in nano-pillar compressions
Yazar:: Jérusalem, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2012)

Simulation and Modeling of Novel Electronic Device Architectures with NESS (Nano-Electronic Simulation Software): A Modular Nano TCAD Simulation Framework
Yazar:: Cristina Medina-Bailon, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-06-01)

Atomistic and Continuum Simulations on Tensile Property of a Single Crystal Metal with Nano-holes
Yazar:: Mehdi Rezaei Farimani, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2007-12-01)

Electrostatics studies and molecular dynamics simulations of a homology model of the Shaker K+ channel pore.
Yazar:: Ranatunga, K, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2001)

A hydrophobic gating mechanism for nanopores
Yazar:: Beckstein, O, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2001)

Pore-Scale Simulation of Particle Flooding for Enhancing Oil Recovery
Yazar:: Xiangbin Liu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2021-04-01)

The dielectric properties of water within model transbilayer pores
Yazar:: Sansom, M, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (1997)

Radio continuum surveys and galaxy evolution: modelling and simulations
Yazar:: Slyz, A, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

Pore-Scale Modeling of Methane Hydrate Dissociation Using a Multiphase Micro-Continuum Framework
Yazar:: Zhiying Liu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2023-11-01)

Dielectric Properties of Aqueous Electrolyte Solutions Confined in Silica Nanopore: Molecular Simulation vs. Continuum-Based Models
Yazar:: Haochen Zhu, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2022-02-01)

Structure and dynamics of K channel pore-lining helices: a comparative simulation study.
Yazar:: Shrivastava, I, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2000)

Inflammation and the continuum model: time to acknowledge the molecular era of tendinopathy.
Yazar:: Millar, N, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2016)

Not ions alone: barriers to ion permeation in nanopores and channels.
Yazar:: Beckstein, O, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2004)

Induction of nano pore in Agrobacterial hemoglobin
Yazar:: Mojtaba Tousheh, ve diğerleri
Baskı/Yayın Bilgisi: (2014-01-01)