Inferring structural variant cancer cell fraction

We present SVclone, a computational method for inferring the cancer cell fraction of structural variant (SV) breakpoints from whole-genome sequencing data. SVclone accurately determines the variant allele frequencies of both SV breakends, then simultaneously estimates the cancer cell fraction and SV...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính: Cmero, M, Yuan, K, Ong, CS, Schröder, J, PCAWG Evolution and Heterogeneity Working Group, Corcoran, NM, Papenfuss, T, Hovens, CM, Markowetz, F, Macintyre, G, PCAWG Consortium
Tác giả khác: Yang, T-P
Định dạng: Journal article
Ngôn ngữ:English
Được phát hành: Springer Nature 2020